Geri Dön

Hastalık gen ilişki çalışmalarında kullanılan bayesçi yöntemlerin incelenmesi

Analysis of bayesian models used for case-control studies

PDF İndir

  1. Tez No: 194449
  2. Yazar: AYSUN ÇETİNYÜREK
  3. Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. ATİLLA HALİL ELHAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoistatistik, Biostatistics
  6. Anahtar Kelimeler: Bayesçi, genetik epidemiyoloji, HW dengesi, İlişkianalizi, MZMC, Bayesian, genetic epidemiology, HW equilibrium, asociationanalysis, MCMC
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoistatistik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Genetik epidemiyoloji, hastalık ve genetik yapı arasındaki ilişkininincelendiği süreçtir. Bu süreçte hastalığın kalıtsal olup olmadığından başlanarak,kalıtsal olduğu düşünülen hastalıklar için çeşitli analizlerle hastalığa neden olangen(ler) bulunmaya çalışılır. Tek gen hastalıkları basit analizlerle bulunabilirkensöz konusu hastalıklar kompleks hastalıklar olduğunda analizler karmaşıklaşır.Hastalık gen ilişki çalışmaları, bağlantı analizini tamamlayıcı olarakyapılan analizlerdir. Bu analizler sayesinde hastalıkla genotipik ve alelik bazdailişki olup olmadığı test edilir. Lojistik regresyon analizi kullanılarak genotiplerinhastalığa olan etkisi araştırılır.Çalışmamızda, Bayesçi yöntemlerin hastalık gen ilişki çalışmalarındakullanımı, Bayesçi modelleri uygulayabilmek için Markov Zinciri Monte Carlo(MZMC) yöntemleri kullanılacaktır. Ayrıca, popülasyon genetiğinin temelprensiplerinden Hardy Weinberg dengesinin analize etkisi araştırılmıştır.Sonuç olarak önsel bilgi ve Hardy Weinberg dengesinin bulunupbulunmamasına göre lojistik regresyon, geriye dönük modeller, bayesçi lojistikregresyon sonuçları iki lokus için karşılaştırılmıştır. Değişik durumlarda geriyedönük modeller ve bayesçi lojistik regresyon arasında seçim yapılmasıönerilmiştir.

Özet (Çeviri)

Genetic epidemiology is the process of analysing the association betweena disease and genetic components. In this process, first of all, it is determinedthat whether the disease is genetically inherited, then if the disease has geneticcomponent, disease predisposing/causing gene(s) are searched. The analysisof monogenic diseases are easier than that of complex diseases.Disease-gene association studies are complementary to linkage studies.By doing these studies, the association between the disease and the gene isanalyzed at both allelic and genotypic levels. Logistic regression analysis isused to determine the effect of genotype to the disease.In this study, the usage of bayesian methods in disease-gene associationstudies and the usage of MCMC techniques which makes possible to apply thebayesian models are shown. In addition, the effect of Hardy WeinbergEquilibrium, the basic principle of population genetics, is also included.As a result, depending on usage of prior knowledge and Hardy Weinbergequilibrium, logistic regression, retrospective models and bayesian logisticregression results are compared for two loci. Under different situations,retrospecive model or bayesian logistic regression should be preferred.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    541876

    Rupture status investigation of patient specific cerebral aneurysms by analysing hemodynamic factors using computational fluid dynamics

    Hesaplamalı akışkanlar dinamiği kullanarak hemodinamik faktörlerin analizi ile hastaya özgü beyin anevrizmalarının yırtılma durumu incelemesi

    GÜLBAHAR MERVE NARİNSES

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Hesaplamalı Bilim ve Mühendislik Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. MUSTAFA SERDAR ÇELEBİ

  2. Tez No

    158156

    Akut rejeksiyonda ve kronik allograft nefropatisinde panel reaktif antikor ve Fcγ reseptör gen polimorfizmi

    Başlık çevirisi yok

    NEŞE ÖZKAYIN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEge Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVGİ MİR

  3. Tez No

    472911

    Development of novel tools for cancer diagnosis, prognosis and treatment using intra- or inter-species transcriptome meta-analysis

    Tür içi ve türler arası transkriptom meta-analizi kullanılarak kanser teşhisi, prognozu ve tedavisi için yeni araçların geliştirilmesi

    HUMA SHEHWANA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Genetikİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ÖZLEN KONU KARAKAYALI

  4. Tez No

    634255

    Otizm spektrum bozukluğu tanısı alan hastalarda genetik ve çevresel etiyolojik faktörlerin araştırılması

    Investigation of genetic and environmental etiological factors in patients diagnosed with autism spectrum disorder

    ZEYNEP İZEM PEKER BULĞAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. TANJU ÇELİK

    DOÇ. DR. AYŞE KUTLU

  5. Tez No

    612018

    Differential expression of proteins in active and inactive phases of Behçet's syndrome

    Behçet sendromunun aktif ve inaktif fazlarında farklı protein ekspresyonları

    KIYMET ASLI KİREÇTEPE AYDIN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Tıbbi Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI

Geri Dön