Doğu ve güney doğu anadolu bölgelerinde koyun ve keçi theileriosisinin mikroskopik ve moleküler yöntemlerle araştırılması
Survey of theileriosis in sheep and goats in east and southeast anatolia region by microscopical and molecular methods
- Tez No: 192691
- Danışmanlar: DOÇ.DR. MÜNİR AKTAŞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Theileriosis, mikroskopik bakı, PCR, koyun, keçi.23, Theileriosis, microscopic examination, PCR, sheep, goat
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Fırat Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Parazitoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Doğu ve Güney Doğu Anadolu Bölgelerinde Koyun ve KeçiTheileriosisinin Mikroskopik ve Moleküler Yöntemlerle AraştırılmasıKürşat AltayBu araştırma, Haziran 2004 - Eylül 2005 tarihleri arasında Doğu veGüneydoğu Anadolu bölgelerinde koyun ve keçilerde Theileria ovis ve T.lestoquardi'nin varlığı ve yayılışının belirlenmesi amacıyla yapılmıştır. Buamaçla, ilk aşamada T. ovis'in teşhisine yönelik spesifik PCR metodu geliştirilmişve daha sonra koyun ve keçilerde T. ovis'in yayılışı ile aynı bölgede T.lestoquardi'nin varlığı araştırılmıştır.Theileria ovis Erzincan koyun izolatına ait 18S SSU rRNA gen dizisi(Genbank No: AY508453) esas alınarak iki çift primer dizayn edilmiştir.Primerler önce bilgisayar ortamında BLAST programı uygulanarak genbankasında mevcut sekanslara karşı, daha sonra laboratuvarda PCR ile T. ovis, T.lestoquardi, T. annulata, T. parva, T. buffeli ve Babesia ovis'e karşı testedilmiştir. Ayrıca parazitemi oranı bilinen enfekte kanın % 10-2, % 10-3, % 10-4, %10-5, % 10-6, % 10-7 ve % 10-8 basamaklarındaki dilüsyonları kullanılarak bumetodun, T. ovis'i belirleme limiti (sensitivite) tespit edilmiştir.Doğu ve Güneydoğu Anadolu bölgelerinde bazı illere ait farklıodaklardaki koyun ve keçilerden 819 EDTA'lı kan örneği toplanmış (677 koyun,142 keçi) ve bu kanlardan 795 kan frotisi (656 koyun, 139 keçi) hazırlanmıştır.Bunlara ilaveten Mardin ilinde theileriosisiden şüpheli 27 koyundan, ayrıca lenffrotisi hazırlanmıştır. EDTA'lı kanlardan ekstrakte edilen DNA'lar, T. ovis ve T.lestoquardi yönünden PCR ile, kan ve lenf frotileri Theileria'nın piroplasm veşizont formları yönünden mikroskopik bakı ile incelenmiştir.1Ayrıca Muş ve Malatya illerinde koyunlardan 531, keçilerden 89 olmaküzere toplam 620 adet erişkin kene toplanmıştır. Toplanan keneler steromikroskop altında incelenerek tür teşhisleri yapılmıştır.Theileria ovis ile doğal enfekte koyun ve keçilerden elde edilen kanlardaparazitin 398 baz çifti uzunluğundaki bir bölümü nested PCR ile spesifik olarakamplifiye edilmiştir. Buna karşılık, bu primerlerin diğer Theileria türleri ile B.ovis'i amplifiye etmediği görülmüştür. Nested PCR'ın paraziti belirleme limiti%10-5 olarak belirlenmiştir. Bu değer, metodun T. ovis'i on milyonda bir enfekteeritrositte belirleyebilecek duyarlılıkta olduğunu göstermiştir.Kan frotilerinin mikroskopik muayenesinde, 656 koyunun 120 (%18,29)'sinde, 139 keçinin 4 (% 2,87)'ünde Theileria spp. piroplasm formları tespitedilmiştir. Lenf frotilerinin hiç birinde parazitin şizont formlarına rastlanmamıştır.İlk aşama PCR sonucunda, incelenen 677 koyunun 308 (% 45,49)'inde, 142keçinin 9 (% 6,34)'unda T. ovis amplifiye edilmiştir. Nested PCR sonucunda ise,koyunların 398 (% 58,78)'inde, keçilerin 16 (% 11,26)'sında T. ovis amplifiyeedilmiştir. Aynı hayvanların hiç birinde PCR ile T. lestoquardi'nin varlığınıgösterecek amplifikasyon ürünü elde edilememiştir.Koyun ve keçilerin üzerinden toplanan keneler Rhipicephalus bursa ve R.sanguineus olarak identifiye edilmiştir.Gerek mikroskopik muayene ile PCR sonuçları arasındaki fark ve gerekseilk aşama PCR ile nested PCR sonuçları arasındaki fark istatistiksel olarak anlamlıbulunmuştur (P<0,01). T. ovis enfeksiyonları keçilere göre koyunlarda dahayüksek bulunmuş ve aradaki farkın istatistiksel olarak önemli olduğu ortayakonmuştur (P<0,01).
Özet (Çeviri)
Survey of Theileriosis in Sheep and Goats in East and Southeast AnatoliaRegion by Microscopical and Molecular MethodsKursat AltayThis study was carried out to determine the presence and distribution ofTheileria ovis and T. lestoquardi in sheep and goats in East and SoutheastAnatolian regions between June 2004 and September 2005. Firstly, a nestedpolymerase chain reaction (PCR) method was developed for the specific diagnosisof T. ovis, and then the prevalence of T. ovis in sheep and goats was investigatedby the method. In addition, the presence of T. lestoquardi in the same region wasalso investigated.Two oligonucleotide primers were designed from the 18S SSU rRNA genesequence (Genbank No: AY508453) of T. ovis isolated from sheep in Erzincan.The primer sequences were tested with BLAST program in computer. Then,DNAs from T. ovis, T. lestoquardi, T. annulata, T. parva, T. buffeli and Babesiaovis were tested in the PCR in laboratory. In addition, detection limit of the PCRfor T. ovis was determined using dilution of T. ovis-infected erythrocytes with %10-2, % 10-3, % 10-4, % 10-5, % 10-6, % 10-7 and % 10-8 parasitemia.A total of 819 whole blood (677 sheep and 142 goats) and 795 bloodsmear (656 sheep and 139 goats) were collected from sheep and goats at differentlocations in the region. At the same time, 27 lymph smear samples were collectedin sheep in Mardin. In addition, a total of 531 tick in sheep and 89 ticks in goatswere collected in Mus and Malatya provinces. Ticks were examined under stereo-microscope for species identification. T. ovis and T. lestoquardi DNAs extractedfrom sheep and goats blood were amplified by PCR using species-specificprimers. Blood and lymph smears were examined for Theileria piroplasms andschizonts forms by microscopic examination (ME).A 398-bp DNA fragment was specifically amplified from blood samplesfrom sheep naturally infected with T. ovis. No PCR products resulted from T.lestoquardi, T. annulata, T. parva, T. buffeli and B. ovis DNA using these specificprimers. The sensitivity of the nested PCR for T. ovis which was assessed showedthat one infected cell in 107 sheep erythrocytes, equivalent to a blood parasitemiaof 10-5 %, could be detected.In the microscopic examination of blood smears, Theileria spp. piroplasmswere observed in 120 out of 656 sheep (18.29 %) and 4 out of 139 goats (2.87 %),respectively. Schizont forms of the parasite were not seen in lymph node smears.Of the 819 field samples obtained from 677 sheep and 142 goats tested, 308(45.49 %) and 9 (6.34 %) were positive for the presence of T. ovis by the firstround PCR, respectively compared to 398 (58.78 %) and 16 (11.26 %) positive forT. ovis by nested PCR. T. lestoquardi was not amplified in the same animals byPCR.Ticks collected from sheep and goats were identified to be Rhipicephalusbursa and R. sanguineus on the basis of morphological features.The differences between ME and PCR results and between the first roundand nested PCR results were statistically significant (P<0.01). The frequency of T.ovis infection was higher in sheep than in goats and difference between theinfection rates of sheep and goats were found to be statistically significant(P<0.01).
Benzer Tezler
- Echinococcus granulosus'un Doğu ve Güneydoğu Anadolu Bölgesi izolatlarının moleküler ayrımı
Molecular discrimination of East and Southeast Anatolian Region isolates of echinococcus granulosus
ARMAĞAN ERDEM ÜTÜK
Doktora
Türkçe
2008
Veteriner HekimliğiFırat ÜniversitesiVeterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERGÜN KÖROĞLU
- Erken Hristiyan ve ilk Bizans resim ve kabartma sanatında kaynak ve okullar (2 cilt)
Sources and school of painting and sculpture during the early Christian and first Byzantine period
AHMET MEHMET KİPMEN
- Günümüzde Sarıgöl ve çevresinde görülen havsız dokumalardaki motiflerin aşiretlerle bağlantıları
The relationships between tribal groups and the patterns used in their flat woven rugs around Sarıgöl
KAMİL GÜLLER
Sanatta Yeterlik
Türkçe
2004
El SanatlarıMarmara ÜniversitesiGeleneksel Türk El Sanatları Ana Sanat Dalı
PROF. ŞERİFE ATLIHAN