Bazı moleküllerin kristal yapı çözümleri
Analyses of crystal structure of some molecules
- Tez No: 185659
- Danışmanlar: PROF.DR. NEZİHE ÇALIŞKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Fizik ve Fizik Mühendisliği, Physics and Physics Engineering
- Anahtar Kelimeler: Benzofuran, Siklobütan, Tiyazol, Schiff Bazı, Tiyosemikarbozon, Piperazin, X-Işınları Kırınımı, Hidrojen Bağı, Benzofuran, Cyclobutane, Thiazol, Schiff Base, Thiosemicarbazone, Piperazine, X-Rays Diffraction, Hydrogen Bonding
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Fizik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
IÖZETBu çalışmada benzofuran, siklobütan, tiyazol, schiff bazı, tiyosemikarbazon(thsc) ve piperazin gibi grupları içeren ve kapalı formülleri, C20H18O2 (I),C24H27N3O2S.C2H6O (II), C38H56N8S2.C2H6OS.C2H12OS (III), şeklinde olankristallerin yapı analizleri, tek kristal X-ışını yöntemiyle yapılmıştır. Atomikparametrelerin arıtımı ise, tam-matris en küçük kareler ve Fark-Fourier yöntemlerikullanılarak yapılmıştır.(I) nolu kristaldeki benzofuran halkasının düzlemselliğe yakın olduğugözlenmiş, siklobütan halkasındaki yan gruplar arasında gerçekleşen steriketkileşmeler, bu halkanın düzlemsellikten sapmasına neden olmuştur. Siklobütanhalkasındaki bükülme ise 29.03(13)° dir. Bu değer II ve III nolu kristallerdebulunan siklobütan halkasındaki bükülmeyle karşılaştırıldığında ( 26.8 (2)° ve27.32 (0.25)Ë ) biraz farklı olduğu gözlenmiştir.(II) nolu kristaldeki tiyazol halkası ve mesitil grubunun her birinin düzlemselolduğu gözlenmiş, tiyazol halkasındaki, S1-C16 ve S1-C17 bağ uzunluklarının, S-C (sp2) arasındaki tek bağın mümkün değerinden daha kısa olduğu bulunmuştur.(III) nolu kristaldeki thsc (NH2âNHâC(âS)â NH2) molekülünün, molekül içiNâHâ¦N hidrojen bağlarının etkisiyle E konfigürasyonunda olduğu, görülmüştür.Piperazin molekülünün, hemen hemen mükemmel koltuk konformasyonunda olduğuve bükülme parametrelerinin ise q2= 0.0066 (0.0031)à , q3= - 0.5836 (0.0031) à ,QT= 0.5837 (0.0031) à , θ2= 179.35 (0.30)Ë şeklinde olduğu bulunmuştur.(II) nolu kristalin bir tane etanol molekülü içerdiği, (III) nolu kristal yapının iseiki bağımsız DMSO molekülü içerdiği bulunmuştur. Bu moleküller, kristallerlemoleküller arası bağ yaparak, kristallerin kararlı bir düzenlenişe sahip olmalarınaneden olmuşlardır.Yapı analizi sonucunda, (I) ve (III) nolu kristallerin monoklinik P21/n uzaygrubunda, (II) nolu kristalin ise triklinik P-1 uzay grubunda olduğu belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
IIABSTRACTIn this study, analyses of crystal structures containing benzofuran,cyclobutane, thiazole, schiff base, thiosemicarbazone, piperazine of C20H18O2 (I),C24H27N3O2S.C2H6O (II), C38H56N8S2.C2H6OS.C2H12OS (III) have been determinedby X-ray diffraction method. Atomic parameters were refined by least squares andFourier teqniques.It is observed that benzofuran ring of (I) crystal is nearly coplanar. The stericinteraction between the substituent groups on the cyclobutane rings mean that thisring deviates significantly from planarity. The puckering of cyclobutane ring is29.03(13)°. When this value compareted with the puckering of cyclobutane ring of(II) and (III), it was observed that deviated from the values reported ( 26.8(2)° ve27.32 (0.25)Ë ).It is observed that the thiazole ring and mesityl group of (II) crystal are eachplanar, in the thiazole ring the S1-C16 and S1-C17 bond lengths are shorter thanthe accepted volue for an S-C (sp2) single bond.Thsc moiety (NH2âNHâC(âS)âNH2) of (III) crystal has a E conformationby intramolecular NâHâ¦N hydrogen bonds. It is observed that piperazine moietyadopts an almost perfect chair conformation and the puckering parameters are q2=0.0066 (0.0031)à , q3 = - 0.5836 (0.0031) à , QT= 0.5837 (0.0031) à , θ2= 179.35(0.30)Ë.It is observed that crystal structure of compound (III) contains twoindependent DMSO molecules while crystal structure of compound (II) contains aethanol molecule. Because this molecules make intermolecules bond with crystals,crystals has stabilized.The crystal analyses have given that crystal indicated (I) and (III) monoclinicsystem with P21/n space group while crystal indicated with (II) is in the triclinicsystem with P-1 space group.
Benzer Tezler
- Bazı moleküllerin kristal yapı çözümleri
The analyses of crystal structures of some molecules
CEMİLE DAĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
Fizik ve Fizik MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiPROF. DR. NEZİHE ÇALIŞKAN
- Makromoleküler kristalografide x-ışınının bozucu etkilerinin enerjiye bağlı olarak incelenmesi
Energy dependence radiation damage studies in macromolecular crystallography
MEHMET ASLANTAŞ
Doktora
Türkçe
2006
BiyofizikHacettepe ÜniversitesiFizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ENGİN KENDİ
- X-ışını kırınımı yöntemi ile bazı schiff bazı ve fosfazen ligandlarının kristal yapı analizleri
Crystal structure analysis of some schiff base and phosphazene ligands by x-ray diffraction method
NURCAN AKDURAN CALINLI
Doktora
Türkçe
2002
Fizik ve Fizik MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TUNCER HÖKELEK
- Yapılarında tricyclo (3,3,1,1) decane bulunduran bazı ilaç bileşiklerinin moleküler şekillenimleri ile dithiophosphonate türevi nikel kompleksinin kristal yapıları
The Molecular conformations of some drug compounds which have tricyclo (3,3,1,1) decane group and crystal structures of two dithiophosphonate nickel complexes
YUSUF ÖZCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2002
Fizik ve Fizik MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEMRA İDE
- ab-initio yöntemlerle bazı moleküllerin kristal örgü içinde moleküler orbital hesaplamalarının yapılması ve x- ışını kırınımı ile elde edilen deneysel sonuçlarla karşılaştırılması
Moleculer orbital calculations of some molecules by using ab-initio methods and x-ray diffraction results
MUSTAFA MURAT CANDAN
Doktora
Türkçe
2001
Fizik ve Fizik MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENGİN KENDİ