Bazı Alkanna türlerinin ekstre ve fraksiyonlarının DNA topoizomeraz I inhibisyonu üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation on DNA topoisomerase I inhibition effects of the extracts and fractions of some Alkanna species
- Tez No: 182595
- Danışmanlar: DOÇ.DR. ERDAL BEDİR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Eczacılık ve Farmakoloji, Moleküler Tıp, Bioengineering, Pharmacy and Pharmacology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Alkanna, Boraginaceae, Biyoaktivite Rehberli Fraksiyonlama, DNA Topoizomeraz I nhibisyonu, Sitotoksisite, MTT, Alkanna, Boraginaceae, Bioassay Guided Fractionation, DNATopoisomerase I nhibition, Cytotoxicity, MTT
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalı mada, Alkanna türleri metanolik ekstrelerinin (A. tubulosa, A.cordifolia, A. tinctoria, A. hirsutissima, A. orientalis), MTT testi kullanılarak 5 kanser(K-562, MCF-7, HL-60, SaOs-2, Hep-3B) ve 2 normal hücre hattına kar ı (L929,Vero) sitotoksik etki taramaları yapılmı tır. Yüksek sitotoksisite gösteren Alkannatürleri, süper sarmal plazmid DNA gev eme testi ile DNA Topoizomeraz I inhibisyonpotansiyelleri de erlendirilmi tir. Türler arasında A. cordifolia 8 µG/mL'den 32µG/mL'ye kadar artan dozlarda kültüre hücre hatlarına kar ı inhibisyon etkisigöstermi tir. Önemli sitotoksisite ve DNA topoizomeraz I inhibisyonu gösteren A.cordifolia, ileri izolasyon için seçilmi tir. Ön fraksiyonlamada A. cordifolia metanolikekstresi, optimum fraksiyonlama sistemini belirlemek amacıyla farklı stasyoner fazlarda(Silika jel, Kar ıt faz-C18 and Sephadex LH-20) Açık Kolon Kromatografisi veVakum Sıvı Kromatografisi'ne uygulanmı tır. Silika jel kolondan S2, S9, S10 ve Kar ıtfaz-C18'den RP5, RP6, RP7, RP8 fraksiyonları, 10 ng/mL konsantrasyonda güçlü DNAtopoizomeraz I inhibisyonu gösterirken, Sephadex LH-20'den elde edilen SF2fraksiyonu inhibitör aktivite sergilememi tir.Büyük ölçekli fraksiyonlama, normal faz silika jel kullanılarak, Biotage SP-2Yüksek Performans Fla Kromatografi'de gerçekle tirilmi tir. Çünkü aktif fraksiyonlar,silika jel ile iyi bir da ılım göstermi tir. Biotage Fla Kromatografi'den .T.K.profillerine göre 27 alt fraksiyona ayrılan 536 fraksiyon toplanmı tır. 69-80; 81-91; 92-110 arası fraksiyonlar ve hekzan ekstresi, 10 ng/mL konsantrasyonda aktif bulunmuiken, 1 ng/mL seviyesinde DNA topoizomeraz I inhibisyonu gözlenmemi tir.
Özet (Çeviri)
In this study, methanolic extracts of the Alkanna species (A. tubulosa, A.cordifolia, A. tinctoria, A. hirsutissima, A. orientalis) were screened for cytotoxicactivity against 5 cancer cell lines (K-562, MCF-7, HL-60, SaOs-2, Hep-3B) togetherwith 2 normal cell lines (L929, Vero) by using MTT Test. Alkanna species whichexhibited promising cytotoxicity were evaluated for their DNA topoisomerase Iinhibition potentials by means of Supercoil Plasmid DNA Relaxation Assay. Among thespecies, A. cordifolia has shown inhibition effect against cultured cell lines at the dosesranging from 8 µG/mL to 32 µG/mL. A. cordifolia exerting significant cytotoxicityand DNA topoisomerase I inhibition was selected for further purification. Inpreliminary fractionation, methanolic extract of A. cordifolia was subjected to differentstationary phases (Silica gel, RP-C18 and Sephadex LH-20) by using Open ColumnChromatography and Vacuum Liquid Chromatography (VLC) to determine optimumfractionation system. Fractions S2, S9, S10 from silica gel column and RP5, RP6, RP7,RP8 obtained from RP-C18 exhibited strong DNA topoisomerase I inhibition at 10ng/mL concentration, whereas SF2 obtained from Sephadex LH-20 showed noinhibitory activity.Since the active fractions were spread out well by silica gel, scale-upfractionation was performed on Biotage SP-2 High Performance Flash Chromatographyby using normal phase silica gel. Biotage Flash Chromatography yielded total of 536fractions which were pooled into 27 subfractions based on their Thin LayerChromatography profiles. Fractions 69-80; 81-91; 92-110 and hexane extract wereactive at 10 ng/mL while no DNA topoisomerase I inhibition was observed at 1 ng/mL.
Benzer Tezler
- Bazı Alkanna türlerinin biyoaktivite rehberli izolasyon yöntemi kullanılarak çeşitli kanser hücreleri üzerindeki sitotoksik etkilerinin in vitro ortamda taranması
In vitro screening of cytotoxic effects of some Alkanna species on various cancer cell lines by using bioassay-guided isolation
ŞEBNEM BIÇKICI
Yüksek Lisans
Türkçe
2006
BiyomühendislikEge ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ERDAL BEDİR
- Bazı doğal bitkilerin tekstil boyar maddesi kaynağı olarak kullanılma olanakları üzerinde bir araştırma
Başlık çevirisi yok
GÖNÜL PAKSOY
- Korozyona karşı kullanılabilecek bazı oksit fazı inhibitörlerinin etkinliklerinin araştırılması
Başlık çevirisi yok
HÜLYA KAHYAOĞLU
- Bardat (Gülnar-İçel) yaylasının floristik yapısı
Flora of the Bardat (Gülnar-İçel) highplateau
HEDİYE KILIÇ
- Bazı esterlerin kinetik incelenmesi ve termodinamik parametrelerin belirlenmesi
Kinetic study and detesmination of thermodnamic parameters of some esters
İBRAHİM TAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Kimya MühendisliğiUludağ ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CEBE