Geri Dön

Targeted disruption of Homoserine dehydrogenase gene in Streptomyces clavuligerus and its effects on cephamycin C production

Streptomyces clavuligerus'da homoserin dehidrogenaz geninin hedeflenmiş blokasyonu ve bunun sefamisin C üretimi üzerine etkileri

PDF İndir

  1. Tez No: 180997
  2. Yazar: AYŞE KOCA ÇAYDAŞI
  3. Danışmanlar: PROF.DR. GÜLAY ÖZCENGİZ, Y.DOÇ.DR. EBRU İNCE YILMAZ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Streptomyces clavuligerus, homoserin dehidrogenaz, sefamisinC, aspartat metabolik yolu, gen blokasyonu, Streptomyces clavuligerus, homoserine dehydrogenase, cephamycin C, aspartate pathway, gene disruption
  7. Yıl: 2006
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

ÖZSTREPTOMYCES CLAVULIGERUS'DA HOMOSERİN DEHİDROGENAZGENİNİN HEDEFLENMİŞ BLOKASYONU VE BUNUN SEFAMİSİN CÜRETİMİ ÜZERİNE ETKİLERİKoca Çaydaşı, AyşeYüksek Lisans, Biyoloji BölümüTez Yöneticisi: Prof. Dr. Gülay ÖzcengizYardımcı Tez Yöneticisi: Yrd. Doç. Dr. Ebru İnce YılmazTemmuz 2006, 94 sayfatürleri, yüksek kapasitede protein ve sekonder metabolitStreptomycesüreticisidirler. Bu grubun önemli türlerinden biri olan Streptomyces clavuligerussekonder metabolit olarak tıbbi açıdan oldukça değerli bir β-laktam antibiyotiği olansefamisin C ve güçlü bir β-laktamaz inhibitörü olan klavulanik asit üretmektedir. S.aspartik asit metabolik yolu β-laktam sentezi için öncülclavuligerus'unmetabolitler sağladığı için çok önemlidir. Bu metabolik yoldan L-lizin, L-metiyonin, L-izolösin ve L-treonin gibi 4 temel amino asit sentezlendiği gibi bir çokönemli öncül metabolit de oluşmaktadır. β-laktam sentezi için gerekli bir öncül olanL-α-aminoadipik-asit (α-AAA), aspartat metabolit yolundan sentezlenen L-lizininkatabolik bir ürünüdür. Aspartik asit yolunun L-lizin dalındaki karbon akışının,sefamisin C biyosentezi için hız sınırlayıcı olduğu bilinmektedir. Aspartatsemialdehid (ASA)'den L-homoserin sentezlenmesi, aspartat metabolik yolunun L-treonin, L- metiyonin ve L-izolösin sentezinine giden çatalının ilk enzimatikreaksiyonudur ve homoserin dehidrogenaz (HSD, EC 1.1.1.3) enzimi tarafındankatalizlenmektedir. S. clavuligerus'ta L-lizin ve α-AAA sentezi için gerekli ASAmiktarı, HSD'ın hücredeki biyosentez seviyesi veya aktivitesinin regulasyonu ilekontrol edilir.NRRL 3585'in homoserin dehidrogenaz geni (hom)S. clavuligeruslaboratuvarımızda daha önce klonlanıp karakterize edilmişti. Şimdiki çalışmada, S.clavuligerus'un hom geni, içine kanamisin dirençlilik kaseti sokulmak suretiyletahrip edilmiş ve inaktive edilen gen bir Streptomyces plazmid vektörü olan pIJ486içerisinde S. clavuligerus'a aktarılmıştır. Kromozomal hom geni ve plazmidüzerindeki bloke edilmiş hom geni arasındaki homolog rekombinasyon sonucuoluşan hom okzotrof bir suş (AK39) seçilmiş ve hom geni blokasyonun sefamisin Cüretimine etkisi incelenmiştir. hom geninin blokasyonu sonucunda, kimyasal olaraktanımlanmış (CDM) besiyerinde sefamisin C spesifik üretiminde 1.7 ile 2.0 misliartış gözlenmiştir.

Özet (Çeviri)

ABSTRACTTARGETED DISRUPTION OF HOMOSERINE DEHYDROGENASE GENEIN STREPTOMYCES CLAVULIGERUS AND ITS EFFECTS ONCEPHAMYCIN C PRODUCTIONKoca Çaydaşı, AyşeM. Sc., Department of BiologySupervisor: Prof. Dr. Gülay ÖzcengizCo-Supervisor: Assist. Prof. Dr. Ebru İnce YılmazJuly 2006, 94 pagesThe members of the genus Streptomyces are well-known for their capacity tosynthesize a vast repertoire of secondary metabolites, including many usefulantibiotics and proteins. Streptomyces clavuligerus is the producer of the medicallyimportant β-lactam antibiotics such as cephamycin C and the potent β-lactamaseinhibitor clavulanic acid. The aspartate pathway of S. clavuligerus is an importantprimary metabolic pathway providing substrates for β-lactam synthesis. Thispathway uses L-aspartic acid as the precursor for the biosynthesis of the aminoacids L-lysine, L-methionine, L-isoleucine, L-threonine and several importantmetabolic intermediates. L-α-aminoadipic acid (α-AAA) required for β-lactamsynthesis is a catabolic product of L-lysine produced from the lysine branch of theaspartate pathway. The carbon flow through the L-lysine-specific branch ofaspartate pathway is limiting for the formation of cephamycin C. Formation of L-homoserine from aspartate semialdehyde (ASA) is the first step of the other branchof the aspartate pathway leading to L-threonine, L-isoleucine and L-methioninesynthesis and is catalyzed by homoserine dehydrogenase (HSD, EC 1.1.1.3).Regulation of the activity or biosynthesis of the HSD of S. clavuligerus determinesthe availability of ASA for the biosynthesis of L-lysine and α-AAA.The gene encoding for homoserine dehydrogenase (hom) was previously clonedfrom S. clavuligerus NRRL 3585 and characterized in our laboratory. In this study,the hom gene was disrupted via insertion of a kanamycin resistance cassette intothis gene which was subsequently transferred to S. clavuligerus cells using theStreptomyces plasmid vector pIJ486. A hom mutant of S. clavuligerus (AK39) wasformed through integration into the chromosome by double crossing over and theeffects of hom disruption on cephamycin C yields were investigated. Disruption ofhom gene resulted in a 1.7 to 2.0 fold increase in specific cephamycin C productionin chemically defined medium (CDM).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    71004

    Adenomyozis teşhisinde histeroskopinin değeri

    Evaluation of hysteroscopy in the diagnosis of adenomyosis

    HARUN TOY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Kadın Hastalıkları ve DoğumSelçuk Üniversitesi

    Kadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CEMALETTİN AKYÜREK

  2. Tez No

    39892

    Makro finansal programlama ve Türkiye deneyi

    Macro financial programming and the Turkish experience

    MEHMET KERİM GÖKAY

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    İşletmeİstanbul Teknik Üniversitesi

    DOÇ.DR. İLBAN ONUR

  3. Tez No

    75059

    Zihinsel ağırlıklı işler için bilişsel görev analizi yöntemi

    Başlık çevirisi yok

    NİLGÜN YAPICIOĞLU FIĞLALI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Endüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET F. ÖZOK

  4. Tez No

    222811

    Targeted self assembly of nanocrystal quantum dot emitters using smart peptide linkers on light emitting diodes

    Akıllı peptid bağlayıcıları kullanarak nanokristal kuvantum noktacık ışıyıcılarının ışık yayan diyotlar üzerinde yüzey malzemesine özgü olarak kendi kendine düzenlenmesi

    GÜLİS ZENGİN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2008

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Elektrik ve Elektronik Mühendisliği Bölümü

    YRD. DOÇ. DR. HİLMİ VOLKAN DEMİR

  5. Tez No

    86368

    Chlamydia trachomatis üretritli hastalarda Azitromisin ve Doksisiklin ile tedavilerin karşılaştırmalı immünomodülatör etkileri

    Comparative immunomodulator effects of Asithromycin and Doxycycline treatments in patients with Chlamydia trachomatis urethritis

    H. NİLGÜN IŞIK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. O. ŞADİ YENEN

Geri Dön