Geri Dön

Cancer-testis gene expression as a biomarker of the genetic variation in the one carbon metabolic pathway

Bir karbon metabolik yolundaki genetik farklılıkların belirleyicisi olarak kanser-testis gen ifadesi

PDF İndir

  1. Tez No: 177189
  2. Yazar: AHMET RASİM BARUTÇU
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ALİ OSMAY GÜRE
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2008
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

İnsanlarda bütün biyolojik tepkimelerde kullanılan tek metil grubu vericisi S-adenozilmetiyonin (SAM)'dir. SAM üretimi için gereken folik asit tüketimi, deoksitimidin monofosfat (dTMP) sentezi için gereklidir ve her iki olay da bir karbon metabolik yolundaki enzimler sayesinde gerçekleşir. Bu enzimlerde sıkça görülen aleller kanser dâhil birçok hastalık ile ilişkilendirilmiştir. Ancak, bu enzimlerde görülen polimorfizmlerin SAM üretimine olan kümülatif etkisi şu ana kadar çalışılmamıştır. Bir karbon metabolik yolundaki enzim alellerinin kümülatif etkisine duyarlı ve buna cevap verebilecek biyolojik bir belirleyicinin teşhisi, bu alanda ilerleme kaydedilmesi için önemlidir. Hipotezimize göre transkripsiyonları DNA demtilasyonu ile ilişkili olan Kanser-Testis (KT) genleri, böyle bir biyolojik belirteç olabilir. Bu çalışmada, küçük hücre dışı akciğer kanserinde (KHDAK) KT gen ifadesi ile bir karbon metabolik yolundaki, metilentetrahidrofolat redüktaz (MTHFR), metiyonin sentaz (MS), indirgenmiş folat taşıyıcısı (RFC) ve metiyonin sentaz redüktaz (MTRR) enzim alelleri ilişkiyi araştırdık. Sonuçlarımız, enzim alelleri arasında linkage disequilibrium olduğunu göstermiş, ayrıca belli bir haplotip ile CT gen ifadesi arasındaki ilişkiyi açığa çıkarmış ve izlenecek adımlarda önemli noktaları aydınlatmıştır.

Özet (Çeviri)

S-adenosyl methionine (SAM) is the sole methyl donor for all biological reactions in humans. Folate consumption, required for SAM generation, is also essential for dTMP synthesis and both events occur via enzymes of the one-carbon pathway. Frequently occurring alleles of these enzymes have occasionally been associated with several diseases including cancer. However, the cumulative effects of the polymorphic variants of these enzymes on S-adenosylmethionine production have not been studied. Tbelirleyicisi he identification of a biomarker that can reflect the collective effect of these allelic variants is critical in moving the field forwards. We hypothesized that Cancer-Testis (CT) genes, whose expression strongly correlates with DNA hypomethylation, could be such a biomarker. In this study, we have pursued an extensive correlation of CT expression and allelic variants of the several one-carbon pathway enzyme genes , including methyltetrahydrofolatereductase (MTHFR), methionine synthase (MS), reduced folate carrier (RFC) and methionine synthase reductase (MTRR) in non-small cell lung cancer. Our results revealed linkage disequilibrium among alleles as well as correlations between given genootypes and CT gene expression, and illuminate the critical next steps that need to be pursued.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    768696

    Baş-boyun kanserlerinin anatomik alt gruplarında set- domain containing 2(SETD2) geninin ekspresyon düzeylerinin incelenmesi ve klinikopatolojik parametreler ile ilişkisinin değerlendirilmesi

    Investigation of expression levels of set-domain containing 2(SETD2) gene in anatomic sub-groups of head-neck cancers and evaluation of its relationship with clinicopathological parameters

    SEYFETTİN ASLAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Kulak Burun ve Boğazİstanbul Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT ULUSAN

    PROF. DR. SEMRA DEMOKAN

  2. Tez No

    939788

    Tiroid kanserinde NRAS geni, hsa-miR-145-5p ve lncRNA-TUG1'in ekspresyon seviyelerinin incelenmesi

    Investigation of expression levels of NRAS gene, hsa-miR-145-5p and lncRNA-TUG1 in thyroid cancer

    SİBEL ÖZALP

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Tıbbi BiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET EMİN ERDAL

  3. Tez No

    735445

    Insan pankreas kanserinin biyoinformatik araçlar ile genom boyu ifade analizi

    Genome wide expression analysis of human pancreatic cancer with bioinformatics tools

    LÜTFİYE KADIOĞLU DALKILIÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Moleküler TıpFırat Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ABDULLAH ASLAN

  4. Tez No

    1000079

    Metiltiodiadenozin fosforilaz (MTAP) eksikliği gösteren küçük hücreli dışı akciğer karsinomlarında (KHDAK) PD-L1 ekspresyon düzeyi, EGFR ve KRAS mutasyonları ile ilişkisi

    The relationship of methylthioadenosine phosphorylase (MTAP) deficiency in non-small cell lung carcinomas (NSLC) with PD-L1 expression level, EGFR and KRAS mutations

    MELİKE URGANCI GÖKPİNAR

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    PatolojiGazi Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NALAN AKYÜREK

  5. Tez No

    875402

    Akciğerin ileri evre skuamöz hücreli karsinomunda dek gen değişikliklerinin prognoz ve immünoterapi tedavisi ile ilişkisi

    Dek gene rearrangement in advanced stage squamous cell carcinoma of the lung the relationship with prognosis and immunotherapy treatment

    HANDE KARABAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    PatolojiPamukkale Üniversitesi

    Tıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FERDA BİR

Geri Dön