Genetic polymorphisms of alcohol inducible CYP2E1 in Turkish population
Türk popülasyonunda alkol ile indüklenebilen CYP2E1 genetik polimorfizmi
- Tez No: 153667
- Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN ADALI, PROF. DR. EMEL ARINÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: SitokromP4502El, genetik polimorfizm, Türkiye popülasyonu, C-1019T / G-1259C, T7678 tek bazlık polimorfızmler, RsaVPstI RFLP, Dral RFLP. vı, SitokromP4502El, genetik polimorfizm, Türkiye popülasyonu, C-1019T / G-1259C, T7678 tek bazlık polimorfızmler, RsaVPstI RFLP, Dral RFLP. vı
- Yıl: 2004
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
oz Türkiye populasyonunda alkol ile induklenebelen cyp2ei genetik polimorfizmi ULUSOY, Gülen Yüksek Lisans, Biyokimya Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Orhan ADALI Yardımcı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Emel ARINÇ Ocak, 2004, 123 sayfa Sitokrom P450 süperailesinin etanol ile indüklenebilen izoformu olan sitokrom P4502E1 (CYP2E1); etanol, aseton, asetaminofen ve klorzokzazon gibi ilaçlar, pek çoğu kanserojen olan endüstriyel çözücüler (benzen ve stiren gibi ) de dahil olmak üzere düşük moleküler ağırlıklı pek çok endojen ve egzojen maddeleri katalize eder. Bunun yanısıra CYP2E1, reaktif oksijen türlerinin oluşmasında da etkindir. Bu izoform, etanol ve izoniazid gibi maddeler ve diyabet ve açlık gibi bazı patofizyolojik durumlarda indüklenir. CYP2E1 geni, kimyasallarla indüklenen kanser gibi pek çok hastalığa maruz kalma riskinde gözlemlenen bireyler arası değişkenlikte etkili olduğu düşünülen genetik polimorfızmler göstermektedir. CYP2E1 polimorfızm frekanslarının çeşitli etnik ve ırksal gruplar arasında değişkenlik gösterdiği kanıtlanmıştır. Bu çalışmada da, önemli iki CYP2E1 polimorfizminin; genin 5'- ucundaki C-1019T / G-1259C ve intron 6'daki T7678A tek bazlık polimorfızmlerinin, Türkiye popülasyonundaki frekansı belirlenmiştir. Bu amaç doğrultusunda, Türkiye popülasyonunu temsil eden 132 sağlıklı gönüllüden kan örnekleri toplanmış ve bu örneklerden genomik DNA parçalanmamış halde izoleedilmiştir. Genotipler, bahsedilen bölgelerin polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmasıyla elde edilen gen fragmanlarının, restriksiyon endonükleazlar Rsal, Pstl (C-1019T / G-1259C polimorfızmleri için) ve Dral (T7678A polimorfızmi için) ile kesilmesiyle belirlenmiştir. C-1019T / G-1259C tek bazlık polimorfızmleri yeni jenerasyonlara birbirlerine bağlı olarak aktarılırlar. Bu polimorfızmi erin genotipi 116 DNA örneği için belirlenmiştir ve frekans dağılımı homozigot yabanıl (cl/cl) genotip için %97,4, heterozigot (cl/c2) genotipi için %2,6 ve homozigot mutant (c2/c2) genotipi için %0,0 olarak bulunmuştur. Buna denk düşen alel frekansları yabanıl alel (el) için %98,7 ve mutant alel (c2) için %1,3 olarak hesaplanmıştır. T7678A tek bazlık polimorfızmin genotipi 108 DNA örneği için belirlenmiştir ve genotip frekansları homozigot yabanıl (DD) için %80,6, heterozigot (CD) için %19,4 ve homozgiot mutant (CC) için %0,0 olarak bulunmuştur. Yabanıl (D) alel frekansı %90,3, mutant (C) alel frekansı da %9,7 olarak hesaplanmıştır. Her iki polimorfik bölgenin genotip frekans dağılımının Hardy- Weinberg denklemine uygun olduğu, ve cinsiyete bağımlı bir farklılık göstermediği bulunmuştur. Bu çalışmada belirlenen her iki polimorfızmin genotipik dağılımı, Fransız, İsveç, Alman ve İtalyan gibi diğer Kafkas popülasyonlarıyla Ki-kare testi (x2-testi) uygulanarak karşılaştırıldığında önemli bir farklılık göstermezken, Şili, Japon, Tayvan ve Çin popülasyonlarından önemli derecede farklılık göstermiştir.
Özet (Çeviri)
oz Türkiye populasyonunda alkol ile induklenebelen cyp2ei genetik polimorfizmi ULUSOY, Gülen Yüksek Lisans, Biyokimya Bölümü Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Orhan ADALI Yardımcı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. Emel ARINÇ Ocak, 2004, 123 sayfa Sitokrom P450 süperailesinin etanol ile indüklenebilen izoformu olan sitokrom P4502E1 (CYP2E1); etanol, aseton, asetaminofen ve klorzokzazon gibi ilaçlar, pek çoğu kanserojen olan endüstriyel çözücüler (benzen ve stiren gibi ) de dahil olmak üzere düşük moleküler ağırlıklı pek çok endojen ve egzojen maddeleri katalize eder. Bunun yanısıra CYP2E1, reaktif oksijen türlerinin oluşmasında da etkindir. Bu izoform, etanol ve izoniazid gibi maddeler ve diyabet ve açlık gibi bazı patofizyolojik durumlarda indüklenir. CYP2E1 geni, kimyasallarla indüklenen kanser gibi pek çok hastalığa maruz kalma riskinde gözlemlenen bireyler arası değişkenlikte etkili olduğu düşünülen genetik polimorfızmler göstermektedir. CYP2E1 polimorfızm frekanslarının çeşitli etnik ve ırksal gruplar arasında değişkenlik gösterdiği kanıtlanmıştır. Bu çalışmada da, önemli iki CYP2E1 polimorfizminin; genin 5'- ucundaki C-1019T / G-1259C ve intron 6'daki T7678A tek bazlık polimorfızmlerinin, Türkiye popülasyonundaki frekansı belirlenmiştir. Bu amaç doğrultusunda, Türkiye popülasyonunu temsil eden 132 sağlıklı gönüllüden kan örnekleri toplanmış ve bu örneklerden genomik DNA parçalanmamış halde izoleedilmiştir. Genotipler, bahsedilen bölgelerin polimeraz zincir reaksiyonu ile çoğaltılmasıyla elde edilen gen fragmanlarının, restriksiyon endonükleazlar Rsal, Pstl (C-1019T / G-1259C polimorfızmleri için) ve Dral (T7678A polimorfızmi için) ile kesilmesiyle belirlenmiştir. C-1019T / G-1259C tek bazlık polimorfızmleri yeni jenerasyonlara birbirlerine bağlı olarak aktarılırlar. Bu polimorfızmi erin genotipi 116 DNA örneği için belirlenmiştir ve frekans dağılımı homozigot yabanıl (cl/cl) genotip için %97,4, heterozigot (cl/c2) genotipi için %2,6 ve homozigot mutant (c2/c2) genotipi için %0,0 olarak bulunmuştur. Buna denk düşen alel frekansları yabanıl alel (el) için %98,7 ve mutant alel (c2) için %1,3 olarak hesaplanmıştır. T7678A tek bazlık polimorfızmin genotipi 108 DNA örneği için belirlenmiştir ve genotip frekansları homozigot yabanıl (DD) için %80,6, heterozigot (CD) için %19,4 ve homozgiot mutant (CC) için %0,0 olarak bulunmuştur. Yabanıl (D) alel frekansı %90,3, mutant (C) alel frekansı da %9,7 olarak hesaplanmıştır. Her iki polimorfik bölgenin genotip frekans dağılımının Hardy- Weinberg denklemine uygun olduğu, ve cinsiyete bağımlı bir farklılık göstermediği bulunmuştur. Bu çalışmada belirlenen her iki polimorfızmin genotipik dağılımı, Fransız, İsveç, Alman ve İtalyan gibi diğer Kafkas popülasyonlarıyla Ki-kare testi (x2-testi) uygulanarak karşılaştırıldığında önemli bir farklılık göstermezken, Şili, Japon, Tayvan ve Çin popülasyonlarından önemli derecede farklılık göstermiştir.
Benzer Tezler
- Doğu Akdeniz bölgesinden örneklenen Drosophila melanogaster populasyonlarındaki Gpdh ve In(2L)t ile ilişkili alkol dehidrogenaz (Adh) polimorfizmi ve bu polimorfizmin vücut büyüklüğü karakterleri ile olan ilişkisi
Onthe Alcohol deydrogenase (Adh) polymorphism in context of the polymorphism at Gpdh and In(2L)t, and its relation to body size traits in populations of Drosophila melanogaster from the Eastern Mediterranean region
ERGİ DENİZ ÖZSOY
- Baş-boyun kanserli hastalarda genetik polimorfizmlerin incelenmesi
Investigation of genetic polymorphisms in head and neck carcinoma
SEMRA DEMOKAN
- Önemli zeytin (Olea europaea L.) çeşitlerinin izoenzim polimorfizmleri ve genetik özellikleri
Isoenzyme polymorphisms and genetic characteristics of important olive (Olea europaea L.) cultivars and types
SEVDA DÜLGER
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MURAT ŞEKER
- Türkiye'de alkol bağımlılarında dopamin D2 reseptör (DRD2) gen lokusu polimorfizmlerinin Taq 1 enzimi kullanılarak PCR yöntemi ile belirlenmesi
PCR detection of Taq 1 RFLP at the dopamine receptor (DRD2) gene locus in alcoholics in Turkey
MERAL YİRMİBEŞ KARAOĞUZ
Doktora
Türkçe
1999
Tıbbi BiyolojiGazi ÜniversitesiTıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ADNAN MENEVŞE
- Türkiye kumsallarına yuva yapan deniz kaplumbağalarının genetik yapısı
Genetic structure of the sea turtles nesting on the beaches of Turkey
ARZU KASKA