Şeker pancarı nekrotik sarı damar virüsü (Beet necrotic yellow vein benyvirus, BNYVV)'nun moleküler olarak tanılanması
Molecular detection of Beet necrotic yellow vein benyvirus, BNYVV
- Tez No: 151061
- Danışmanlar: PROF.DR. FİLİZ ERTUNÇ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Şeker pancarı, BNYVV, RT-PCR, PCR-RFLP, Çeşit reaksiyonu, Sugar beet, BNYW, RT-PCR, PCR-RFLP, Variety reaction
- Yıl: 2004
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZET Doktora Tezi ŞEKER PANCARI NEKROTİK SARI DAMAR VİRÜSÜ (BEET NECROTIC YELLOW VEIN BENYVIRVS, BNYW)'NUN MOLEKÜLER OLARAK TANILANMASI H. Diğdem İLHAN Ankara Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Bitki Koruma Ana Bilim Dalı Danışman : Prof. Dr. Filiz ERTUNÇ Türkiye Cumhuriyeti Şeker Fabrikaları Anonim Ortaklığı'na bağlı 10 (Ağrı, Alpullu, Adapazarı, Eskişehir, Malatya, Ankara, Kırşehir, Kastamonu, Çorum ve Turhal) ve 3 özel şeker fabrikasına ait (Konya, Amasya, Kayseri) şeker pancarı ekim alanlarından alınan 183 toprak örneği üzerinde Fiona çeşidi şeker pancarı bitkileri yetiştirilerek, Beet necrotic yellow vein virus'ua (BNYW) varlığı DAS-ELISA testi ile belirlenmiş ve RT- PCR testi uygulanarak moleküler karakterizasyonu ortaya konulmaya çalışılmıştır. Çalışmada kullanılan toplam 183 izolattan 42 izolat DAS-ELISA çalışmalarında pozitif reaksiyon vermiş, RT-PCR çalışmalarında ise bu 183 izolattan 46 tanesinde RNA profili gözlenmiştir. Elde edilen PCR ürünleri RFLP testine tabi tutulmuş, ve bu amaçla Eco RL Hine n, Apa LL Bam HI ve Taq I restriksiyon enzimleri kullanılmış ve büyüklükleri 150 ile 700 bp arasında değişen özgün bantlar elde edilmiştir. Çeşit reaksiyon denemesinde ise Türkşeker Fabrikalarından ve özel fabrikalarda yaygın olarak ekimi yapılan 6 şeker pancarı çeşidi (Hülya, H66140, Verity, Duetto, Evelina, Gina) 8 hafta yetiştirildikten sonra, kök ağırlığına olan etkileri ve DAS-ELISA'da verdikleri absorbans değerleri tespit edilmiş ve varyans analizi yapılarak sonuçlar değerlendirilmiştir. Çeşit reaksiyon denemesinde, kök verimi bakımından Hülya ve Hülya kontrol, H 66140 ve H 66140 kontrol, Verity ve Verity kontrol, Duetto ve Duetto kontrol arasındaki fark önemliyken, Evelina ve Evelina kontrol ile Gina ve Gina kontrol arasındaki fark önemli bulunmamıştır (p£ 0.05). Çeşitlerin ELISA testi yapılan köklerdeki absorbans değerleri (A 405) bakımından Hülya ve Hülya kontrol, H 66140 ve H 66140 kontrol, Verity ve Verity kontrol arasındaki ve Duetto ve Duetto kontrol arasındaki fark önemli olurken, Evelina ve Evelina kontrol ile Gina ve Gina kontrol arasındaki fark önemli bulunmamıştır (p< 0.05). Çeşitlerin ELISA testi yapılan yapraklardaki absorbans değerleri (A 405) bakımından Hülya ve Hülya kontrol, H 66140 ve H 66140 kontrol, Verity ve Verity kontrol ve Gina ve Gina kontrol arasındaki fark önemli bulunurken, Duetto ve Duetto kontrol ile Evelina ve Evelina kontrol arasındaki fark önemli değildir (p <0.05). 2004, 75 sayfa
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Ph.D. Thesis MOLECULAR DETECTION of BEET NECROTIC YELLOW VEIN BENYVIRUS (BNYW) H. Diğdem İLHAN Ankara University Graduate School of Natural and Applied Sciences Department of Plant Protection Supervisor : Prof. Dr. Filiz ERTUNÇ Sugar beet cv. Fiona plants were grown on totally 183 soil samples taken from ten different Turkish Sugar Refinery areas (Ağrı, Alpullu, Adapazarı, Eskişehir, Malatya, Ankara, Kırşehir, Kastamonu, Çorum and Turhal) and three private Sugar Refinery areas (Konya, Amasya, Kayseri), the presence of Beet necrotic yellow vein virus (BNYW) was investigated. The samples were detected by means of DAS-ELISA and the molecular characterization was performed by RT-PCR tests. 42 isolates among 183 were positive in DAS-ELISA tests and 46 gave RNA patterns in RT-PCR tests. The PCR products obtained were later examined by RFLP analysis and Eco RL Hine IL Apa LI, Bam HI and Taq I restriction enzymes were used for this purpose. Spesific patterns of which size vary between 150 and 700 bp were obtained. In variety reaction tests, 6 different cultivars (Hülya, H66140, Verity, Duetto, Evelina, Gina) which are widely grown in Turkey were selected and the effect of BNYW to root weight and ELISA was determined by varians analysis. In variety reaction trials, the difference between Hülya and Hülya control, H 66140 and H 66140 control, Verity and Verity control, Duetto and Duetto control is found to be statistically important, whereas the difference between Evelina and Evelina control and Gina and Gina control was unimportant by means of root crop (p^0.05). The differences between Hülya and Hülya control, H 66140 and H 66140 control, Verity and Verity control and Duetto and Duetto control seems to be important by means of ELISA applied to the roots (A 405), whereas the differences between Evelina and Evelina control and Gina and Gina control is statistically unimportant (p<0.05). In absorbance values of ELISA test (A 405) conducted with sugar beet leaves, the differences between Hülya and Hülya control, H 66140 and H 66140 control, Verity and Verity control and Gina and Gina control is found to be statistically important, the differences between Duetto and Duetto control and Evelina and Evelina control is statistically not important (p <0.05). 2004, 75 pages
Benzer Tezler
- Beet necrotic yellow vein virusa karşı antiserum üretimi
Production of antiserum aganist beet necrotic yellow vein virus
H. DİĞDEM İLHAN
- Alpullu Şeker Fabrikası ekim alanlarında Rhizomania hastalığının yayılma durumu ve toprak özellikleri ile ilişkisi
Dissemination and relationship with soil characteristics of Rhizomania disease in the areas of Alpullu Sugar Factory
RIZA KAYA
- Kastamonu ilinde şeker pancarı üretim alanlarında görülen kök saklanması hastalığının yaygınlık oranı, etmen tanısı, bioekolojisi ve çeşit reaksiyonları üzerinde araştırmalar
Studies on incidence, causal agent, bioecology and variety reactions of root bearded disease seen at sugar beet production areas in Kastamonu
NAZLI DİDE KUTLUK
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
ZiraatGaziosmanpaşa ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SEMİH ERKAN
- Eskişehir ilinde şeker pancarlarında beet mosaic vinus ve beet necrotic yellow vein viruslarının tesbiti üzerine araştırmalar
Başlık çevirisi yok
TANSU HÖBEK
Yüksek Lisans
Türkçe
1995
ZiraatAnkara ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜRSEL ERDİLLER