Directed evolution of multiple stress resistance in Saccharomyces cerevisiae
Saccharomyces cerevisiae`nin yönlendirilmiş evrim yöntemi ile birden fazla strese dirençli hale getirilmesi
- Tez No: 142998
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. ZEYNEP ÇAKAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Bir çok strese dayanıklılık, Saccharomyces cerevisiae, trehaloz, invertaz, multiple stress resistance, Saccharomyces cerevisiae, trehalose, invertase
- Yıl: 2003
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İstanbul Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Saccharomyces cerevisiae bir çok endüstriyel işlemde yaygın olarak kullanılan bir organizmadır. Bu işlemler sırasında Saccharomyces cerevisiae, donma-çözünme, yüksek sıcaklık stresi, yüksek etanol konsantrasyonu, ve oksidatif stres gibi bir çok değişik fizyolojik streslere maruz kalmaktadır. Bu çalışmada, birçok strese karşı dayanıklı S.cerevisiae suşlan geliştirmek için tersine metabolizma mühendisliği yöntemi kullanılmıştır. Bir çok strese karşı dayanıklı fenotiplerin seçimi yüksek genetik çeşitliliğe sahip bir başlangıç mutant popülasyonu elde etmeye yarayan kimyasal mutagenezi de içeren bir evrimsel strateji gerektirmektedir.Mutagenezi takiben mutant populasyonlanna kademe kademe artan stres koşullan uygulanmış, her bir stres uygulamasından sonra hayatta kalanlar, bir sonraki mutant nesilleri olarak seçilmişlerdir. Strese dayanıklı nesillerin hayatta kalma oram en muhtemel sayım yöntemine dayalı yüksek kapasiteli bir tarama ile belirlenmiştir. Donma- çözünme için seçilen nesillerin, başlangıçtaki ata S.cerevisiae ile karşılaştırıldığında, diğer streslere de daha dayanıklı olduğu saptanmıştır. Nesiller, strese karşı dayanıklılıkta önemli bir faktör olan trehaloz depolamaları bakımından da stressiz koşullarda incelenmişlerdir. Mutant populasyonlan büyüme ortamlarındaki yüksek miktarda glukozdan meydana gelen glukoz baskılaması balonundan da incelenmişlerdir. Bu baskılanma mekanizması, hücrelerin glukoz konsantrasyonunun yüksek olduğu şartlarda invertaz üretim kapasitesi açısından izlenmiştir. Bu populasyonlarm stress olmadığı durumlarda bile yüksek miktarda trehaloz biriktirdikleri gözlenmiştir. Tüm bunlara ek olarak, büyüme ortamındaki yüksek glukoz konsantrasyonlanndan, geliştirilen nesillerin baskılanmadığı saptanmıştır. Özetle, bir evrimsel mühendislik yöntemi kullanılarak birçok strese dayanıklılığı belirgin şekilde artmış mutant maya populasyonlan elde edilmiştir. Bu mutantlar stressiz koşullarda da yüksek miktarda trehaloz biriktirmektedirler.
Özet (Çeviri)
Saccharomyces cerevisiae is a widely used organism in many industrial processes. During these processes, S. cerevisiae is exposed to many different physiological stresses such as freezing and thawing, high temperature stress, high ethanol concentrations, and oxidative stress. To develop multi-stress resistant S. cerevisiae strains, an inverse metabolic engineering approach was employed in this study. The selection of multi-stress resistant phenotypes required an evolutionary strategy which includes chemical mutagenesis to obtain an initial mutant population with increased genetic variations. Following mutagenesis, stepwise-increasing stress conditions were applied to the mutant populations and the survivors of each stress application were selected as successive mutant generations. The survival ratios of stress-resistant populations were determined by a high throughput assay based on the most probable number method. The populations selected for freezing/thawing stress were found to have the highest resistance not only to freezing/thawing stress, but also to the other stresses, compared to the initial wild-type S.cerevisiae. The populations were also assayed for their trehalose accumulation under non-stress conditions, which is known as an important factor in stress resistance. Glucose repression caused by high glucose levels in medium was investigated in the mutant populations as well. The repression mechanism was monitored via invertase expression ability of the cells when glucose concentration is high. To summarize, using an evolutionary engineering approach, yeast mutant populations with significantly improved multi-stress resistance were obtained. The mutants also have the ability to accumulate high amounts of trehalose under non- stress conditions. Additionally, they can tolerate high amounts of glucose in their growth medium, without being repressed.
Benzer Tezler
- Sürekli mıknatıslar ve mıknatıslayıcılar
Başlık çevirisi yok
BORA NALBANTOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1996
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. İLHAMİ ÇETİN
- Almancanın yabancı dil olarak öğretimi çerçevesinde dilbilgisi ile sözcük bilgisini çoktan seçmeli test tipi maddelerle ölçme
The tests of grammer and vocabulary with multiple choise test in terms of teaching German as a foreign language
AYFER ÇOLAK TURHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1998
DilbilimAnadolu ÜniversitesiAlman Dili Eğitimi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ALİ GÜLTEKİN
- Genişbandlı şebekelerde hizmet adaptasyon protokolleri
Başlık çevirisi yok
RECEP EVREN PALANDUZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektronik ve Haberleşme Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜNSEL DURUSOY
- Yapım yönetiminde bilgisayar destekli proje planlama ve programlama alt sistemi
Başlık çevirisi yok
F. ASLI YILMAZ
- Çok amaçlı karar vermede yeni bir yöntem ve uygulaması
Application working on trade banking of a new multiple objective decision making method
A.COŞKUN DÜNDAR
Doktora
Türkçe
1995
Endüstri ve Endüstri Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiPROF.DR. RAMAZAN EVREN