Geri Dön

Moleküler tasarım için bilimsel veritabanı geliştirme ve ortak kullanıma hazırlama

Scientific database development for molecular design and preparing for common use

  1. Tez No: 134338
  2. Yazar: İLKER KÖSE
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. NATALİA SHVETS DİMOGLO
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
  6. Anahtar Kelimeler: Biyolojik aktivite, SAR, Tasarım, Veri tabanı, Biological activity, Specific absorption rate, Design, Database
  7. Yıl: 2003
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

OZET Günümüzde biyolojik aktiviteler konusunda oldukça ciddi SAR (Structure-activity Relationships) çalışmaları yapılmaktadır. Bunlarla ilgili bilgilere yazılı ve elektronik ortamda ulaşmak mümkündür. Bu kaynaklara ek olarak web tabanlı SAR hesaplamaları yapan ve moleküler özellikleri veritabanına aktaran yeni gelişmeler de söz konusudur. Bu veritabanları ve hatta veri modelleri, moleküler hesaplama metodları dikkate alınarak hazırlanmıştır. Buradaki çalışmamızda oluşturulan veritabanı ise, yine bir SAR metodu olan lETM-Etecironic-TopotogicatMethod metoduna: göre tasarlanmıştır ETM metodu, şimdiye kadar yapılmış birçok çalışma ile gösterildiği gibi çok sayıda biyolojik aktivite için tahmin yeteneğine sahip bir metottur. Onu diğer SAR metodlarından ayıran en önemli özelliği ise daha çok ilaç tasarımında kullanılan aktif bileşik sentezleri için daha kesin ve tam kurallar getirmesidir. Veritabanı geliştirme çalışması, ETOSAR adı verdiğimiz ana projemizin çekirdek modülünü oluşturmakta ve farklı SAR metodlarının giriş-çıkış formatlarını birbirine çevirme ve entegre etmek için temel teşkil etmeyi amaçlamaktadır. Projenin bir sonraki aşaması, bu çalışmayı geliştirdikten sonra internet ortamında paylaşıma açarak endüstriyel ve akademik araştırmalar için hizmet vermesini sağlamaktır.

Özet (Çeviri)

;ı ??'???? ?. v SUMMARY Structure-activity relationships (SAR) studies are represented by a huge amount of information on various biological activities. They are distributed in a great number of both printed and electronic sources. Recently, in addition to the published results, different Web-resources that contain applications for SAR calculations and databases (DB) on molecular properties become available. The content of the DBs and, to some degree, their models are clearly influenced by the methods used for molecular calculations. Here a DB designed for accumulating and publishing SAR calculations that are the result of the so-called electronic-topological method (ETM) is described. The method is capable of predicting a range of biological activities on the base of previously done ETM-studies. The ETM differs from other SAR approaches in giving strict rules for active compounds synthesis that is especially valuable for drug design. The database development is a core part of a project (ETOSAR) aimed in integrating and exchanging results of different SAR studies, which are presently accessible on the Internet, with wide community of experts both from industry and research centers.

Benzer Tezler

  1. Modeling cellular processes with patika

    Patika ile hücresel olayların incelenmesi

    EMEK DEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2001

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. RENGÜL ÇETİN ATALAY

  2. A comparative study for university campus planning

    Üniversite kampüs planlaması için karşılaştırmalı bir çalışma

    AYŞEN C. BENLİ

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1998

    MimarlıkDokuz Eylül Üniversitesi

    Mimarlık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET TÜREYEN

  3. Yeni Cami'nin akustik açıdan performans değerlendirmesi

    Evaluation of the acoustical performance of the New Mosque

    EVREN YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Mimarlıkİstanbul Teknik Üniversitesi

    Mimarlık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVTAP YILMAZ DEMİRKALE

  4. Bilimsel araştırmalarda karar verebilen uygulamalı bir sistem tasarımı ve gerçekleştirimi

    Design and implementation of an applied system for taking decision in scientific researches

    MEHMET POTUR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NATALİ DIMOĞLU

  5. Yeraltı sularında bulunan uçucu organiklerin dolgulu kulelerde giderilmesi üzerine bir araştırma

    A Study about removal of volatile organic compounds from ground water in packed towers

    ALİ TELLİOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1992

    Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    YRD. DOÇ. DR. İSMAİL TORÖZ