İnterferon+ribavirin tedavisinde virolojik yanıtsız kronik hepatit C hastalarında genotip 1b virüs genomunun interferona hassasiyeti belirleyici (ISDR) dizisinde mutasyonların belirlenmesi
Identification of mutations within the sequence of interferon sensitivity determining region (ISDR) of virus genotype 1b in chronic hepatitis C patients who are virologically nonresponsive to ifn+ribavirin therapy
- Tez No: 132321
- Danışmanlar: PROF. DR. ORHAN TERZİOĞLU, PROF. DR. HAKAN ABACIOĞLU
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Kronik HCV, genotip lb, IFN+Ribavirin, PKR-bağlanma alanı, ISDR, Chronic HCV, genotype lb, IFN+Ribavirin, PKR-binding region, ISDR
- Yıl: 2003
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
1. ÖZET“İnterferon+Ribavirin tedavisine virolojik yanıtsız kronik hepatit C hastalarında, genotiplb virüs genomunun interferona hassasiyeti belirleyici (ISDR) dizisinde mutasyonların belirlenmesi”Dünyada 170 milyon insanı etkileyen Hepatit C Virüs (HCV) enfeksiyonu; %50 -85 kronikleşmeye, bunların % 20' sinde siroz gelişimine ve her yıl 3.5-10 milyon sirozluda karaciğer kanseri görülme riskine yolaçar. AntiHCV pozitifliği, dünyada ortalama % 3, Türkiye'de farklı kaynaklara göre % 0.3-4* tür. Ayrıca Türkiye'de kronik karaciğer hastalıklarında, HCV prevalansı % 13-27'dir. Kronik HCV enfeksiyonunda uygulunan tedavilerin başansızlığındaki etkili mekanizmaların saptanması ve hastalığın etkin tedavi protokollerinin geliştirilmesi gerekmektedir. Uluslararası kronik HCV tedavisi için IFN+Ribavirin kullanımında basan ile ilgili olarak,“çift iplikli RNA'nın aktive ettiği protein kinaz”(double stranded RNA activated protein kinase, PKR) bağlanma alanının etkinliği yayınlandı. HCV'nin non-structural 5 A (NS5A) geninden kodlanan ve PKR-bağlanma alanını kapsayan NS5A proteini, PKR enzimine bağlanarak dimerize olmasına engel olmakta ve hücre ölümünü önlemektedir. Bu durumda virüs üremesine devam etmektedir. NS5A-PKR bağlanma alanında saptanan bazı mutasyonların, in vivo mayada PKR enzimine bağlanmayı önleyerek hücrelerin ölmesine neden olduğu ve virüsün üremesini engellediği gösterildi. Dokuz Eylül Üniversitesi hastanesinde IFN+Ribavirin tedavisi alan, HCV genotiplb üç tam yanıtlı (TYL), beş biyokimyasal yanıtlı (BYL), 1 1 tam yanıtsız (TYS) hastaya ait serum örnekleri çalışıldı. Her bir serumdan proteinaz K yöntemiyle RNA izolasyonu, RT-PCR ile cDNA eldesi ve bu ürünlerden nested PCR ile HCV-NS5A (PKR bağlanma alanını kodlayan bölge) geni amplifiye edilerek DNA dizisi belirlendi. Sonuçta; 86 aminoasit değişiminin 14 (% 16)'ü PKR-bağlanma alanının kapsadığı ISDR bölgesinde, 72 (% 84) 'si bu bölgenin karboksi terminal alanında saptandı. ISDRnin 14 aminoasit değişiminin 12 (% 86) vsi BYL grubunda belirlendi. BYL hasta grubunda ISDR aminoasit değişimi sayısı, TYS hasta grubuna göre istatistiksel olarak anlamlı ölçüde fazla bulundu (p=0.012). Bu araştırma; genotip lb kronik HCV hastalarının IFN+Ribavirin tedavisinde, biyokimyasal yanıt açısından ISDR aminoasit değişimlerinin, önemli bir prediktör faktör olduğunu göstermektedir.
Özet (Çeviri)
2. SUMMARY“Identification of mutations within the sequence of interferon sensitivity determining region (ISDR) of virus genotype lb in chronic hepatitis C patients who are virologically nonresponsive to IFN+Ribavirin therapy”Hepatitis C Virus (HCV) infection which affects 170 million people in the world, carries a risk of chronicity in up to 50-85 % and developing cirrhosis in 20 % of patients. Among the latter about 3.5-10 million of them have an increased risk of hepatocellular carcinoma. AntiHCV positivity is approximately 3 % in the world and 0.3-4 % in Turkey according to different resources. Besides, prevalance of HCV in chronic liver diseases is 13- 27 % in Turkey. Identifying the mechanisms that lead to theraphy failure in chronic HCV infection and improvement of effective therapy protocols are required.“Double stranded RNA activated protein kinase”binding region (PKR-binding region) was reported to be effective in IFN+Ribavirin treatment for international chronic HCV therapies. NS5A protein encoded from the HCV genome nonstructural 5A (NS5A) gene has a PKR-binding region that blocks the dimerization of PKR, resulting in the prevention of cell death and continuation of virus proliferation. Some of the mutations in this region are shown to prevent PKR enzyme binding and virus proliferation and thus lead to cell death in yeast. In this study, sera samples from three complete responders (CR), five biochemical responders (BR) and 11 nonresponders (NR) that were infected by genotype lb HCV and received IFN+Ribavirin therapy in Dokuz Eylul University Hospital were studied. HCV- NS5A (coding PKR binding region) gene was amplified through RNA extraction, RT-PCR and nested PCR and the PCR products were sequenced for mutation analysis. Finally, 86 aminoacid mutations were detected, 14 (16 %) of them were within the ISDR and 72(84%) of them were within the carboxy terminal domain of the protein. 12 (86 %) of 14 aminoacid mutations in the ISDR were detected in the BR group. ISDR aminoacid mutation number in BR patient group is statistically more significant than that in the NR patient group (p=0.012). According to this study, ISDR aminoacid mutations are important predictor factors for biochemical responses in IFN+Ribavirin therapy of genotype lb infected chronic HCV patients.
Benzer Tezler
- Bursa Uludağ Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi'nde 2016-2018 yılları arasında direkt etkili antiviral tedavi alan kronik hepatit c hastalarının retrospektif irdelenmesi
Retrospective analysis of direct acting antiviral therapy in patients with chronic hepatitis c at Bursa Uludağ University Medical Faculty between in the years of 2016-2018
SÜMEYRA ŞİMŞEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiBursa Uludağ ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN HEPER
- Kronik C hepatitinin tedavisinde interferon alfa-2b indüksiyon tedavisi ile interferon alfa-2b ve ribavirin kombinasyon tedavisinin karşılaştırılması
A Comparison of interferon alpha-2b induction therapy with interferon alpha-2b plus ribavirin combination therapy for the treatment of chronic hepatitis C
FATİH BOSTANCI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiKlinik Mikrobiyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. BİLGEHAN AYGEN
- Kronik hepatit-C tanılı hastalarda üçlü tedavi (telaprevir, pegile-interferon alfa ve ribavirin) rejiminin etkinliği ve güvenilirliği
Ithe effectivity and safety of triple therapy (telaprevir, pegile-interferon alfa and ribavirin) in patients with chronic hepatitis-C
MURAT PEKGÖZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
GastroenterolojiUludağ Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SELİM GÜREL
- Kronik hepatit C tedavisinde interferon-alfa; 2a indüksiyon + ribavirin ile peginterferon-alfa; 2a + ribavirin kombinasyonlarının karşılaştırılması
A comparison of interferon alfa-2a induction plus ribavirin combination therapy with peginterferon alfa-2a plus ribavirin combination therapy for the treatment of chronic hepatitis C
HAYATİ DEMİRASLAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BİLGEHAN AYGEN
- Kronik hepatit c tedavisinde ribavirinle kombinasyon halinde verilen pegile interferon alfa-2a veya pegile interferon alfa-2b tedavi rejimlerinin etkinliği ve tedavi başarısını etkileyen faktörler
The efficiency regimes which pegile interferon alfa 2a or pegile interferon alfa 2b in combination with ribavirin treatment and evaluating factors that affecting treatment success
GÖKTUĞ ŞİRİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
GastroenterolojiKocaeli Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER ŞENTÜRK