Geri Dön

Meme kanserlerinde DNA kopya sayısı değişikliklerinin komparatif genomik hibridizasyon (CGH) ile saptanması

Detection of DNA copy number aberrations with comparative genomic hybridization in breast tumors

  1. Tez No: 107608
  2. Yazar: SULTAN CİNGÖZ
  3. Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. OĞUZ ALTUNGÖZ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Meme Kanseri, Komparatif Genomik Hibridizasyon (CGH) VIII, Breast Cancer, Comparative Genomic Hybridization (CGH) IX
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

ÖZET MEME TÜMÖRLERİNDE DNA KOPYA SAYISI DEGIŞDXLDXLERINİN KOMPARATİF GENOMİK HİBRİDİZASYON İLE SAPTANMASI Meme kanseri kadınlar arasındaki en yaygın neoplastik hastalıktır. Meme kanseri progresyonu ve gelişmesinde rol oynayan genetik değişikliklerin büyük bir kısmı daha önceki sitogenetik çalışmalar ve moleküler metodlar ile belirlenmiş olmasına rağmen bir çok nokta hala tam anlaşılamamıştır. Tümör hücrelerinin kültüre edilmesindeki ve metafaz kromozomlarının elde edilmesindeki teknik sorunlardan dolayı konvensiyonel sitogenetik metodlar ile genetik değişiklikleri saptamak zordur. Bu yüzden meme kanserlerindeki sitogenetik çalışmalar diğer solid tümörlerden daha yavaş olmuştur. Komparatif Genomik Hibridizasyon (CGH) insan malignansilerindeki DNA kopya sayısı değişikliklerini, metafaz alanı elde etmeye gerek olmaksızın gösterebilen moleküler sitogenetik bir metoddur. Bu çalışmada, 31 sınıflandırılmamış meme kanseri CGH ile analiz edildi. CGH analiz sonucunda analiz edilen primer meme kanserlerinin %90 (28/31)'ında DNA kopya sayısı değişikliği olduğu saptandı. Bu değişikliklerin çoğu literatürdeki CGH verileri ile paralellik göstermiştir. Özellikle bu DNA kopya sayısı değişikliklerinin lq (15/31), 8q (18/31), 20q (11/31), 12p (11/31), 6p (10/31) kazanımlan ve 17p (12/31), 15q (8/31), 16p (7/31) kayıpları şeklinde olduğu belirlenmiştir. Bu kopya sayısı değişikliklerinin bulunduğu kromozomal bölgeler tümör gelişmesi ve progresyonunda etkili olan genleri içerdiğinden önem taşımaktadır. Bu yüzden bu bölgelerin tanımlanması prognozun belirlenmesinde, tanıda, ve yeni tedavi protokollerinin geliştirilmeside önemli olacaktır.

Özet (Çeviri)

SUMMARY DETECTION OF DNA COPY NUMBER ABERRATIONS WITH COMPARATIVE GENOMIC HYBRIDIZATION IN BREAST TUMORS Breast cancer is the most common neoplastic disease among women worldwide. Despite a wide spectrum of genetic changes underlying the development and progresion of breast cancer have been identified by previous cytogenetic studies and molecular methods has remained poorly understood. It is difficult to detect genetic changes by conventional cytogenetic methods because of the technical difficulties in culturing of tumor cells and obtaining metaphase spreads for cytogenetic analysis. Therefore, progress in the cytogenetic characterization of breast cancer and other solid tumors has been slow. Comparative Genomic Hybridization (CGH) has become a widely used method in molecular cytogenetics to screen DNA copy number changes in human malignancies. In the present study, thirty one unselected primary breast carcinomas were analysed by CGH. CGH analyses indicated that 90 % (28/3 1) of primary breast carcinomas showed DNA copy number changes. Many of DNA sequence copy number changes showed similarity to previous CGH results in the literature. Gains of lq (15 of 3 1), 8q (18 of 3 1), 20q (1 1 of 3 1), 12p (11 of 31), 6p (10 of 31) and lost of 17p (12 of 31), 15q ( 8 of 31), 16q (7 of 31), 22 (8 of 31) were the most frequent genomic imbalances. Regions with increased copy number reveal chromosomal sites that may contain dominant oncogenes, whereas regions with descreased copy number may harbor tumor suppressor gene loci. We believe that the regions of frequent abnormality harbor novel cancer genes, identification of which might be important in diagnosis, prognosis, and the development of new therapy modalities.

Benzer Tezler

  1. Meme ve kolon kanserli hastalarda DNA analizi yöntemi ile somatik DNA değişimlerinin incelenmesi

    Detection of somatic DNA changes in colon and breast cancer patients

    SEMRA DEMOKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    Onkolojiİstanbul Üniversitesi

    Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEJAT DALAY

  2. Sevofluranın DNA hasarı üzerine etkilerinin benign ve malign olgularda comet assay yöntemi ile değerlendirilmesi

    DNA damage evaluated using the alkaline comet assay in benign and malign patients anesthesied with sevoflurane

    ŞEBNEM ERTÜRK (KISA)

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Anestezi ve ReanimasyonAnkara Üniversitesi

    Anesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. OYA ÖZATAMER

  3. Medüller meme kanserlerinde genomik instabilite

    Genomic instability in medullary breast cancer

    ERDİNÇ YÜKSEL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MERAL SAKIZLI

  4. Erken yaş meme kanserlerinde mikrosatellit instabilitesi

    Microsatellite insability in early-onset breast cancer

    ERDENER ÖZER

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Tıbbi BiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MERAL SAKIZLI