Geri Dön

Cicer arietinum L. bitkisinde tale gen ailesi üyelerinin genom düzeyinde tanımlanması, karakterizasyonu ve abiyotik stres altındaki rollerinin araştırılması

Genome-wide identification, characterization of tale gene family members in Cicer arietinum L. and investigation of their role under abiotic stress

PDF İndir

  1. Tez No: 1011482
  2. Yazar: SERDAR COŞKUN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. EMİNE SÜMER ARAS
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biyoloji, Genetik, Biotechnology, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Nohut, ekonomik değeri ve içerdiği besin maddeleri nedeniyle önemli bir bitkidir. TALE transkripsiyon faktörü gen ailesi, bitki ilerlemesi ve gelişiminde çok önemli bir işleve sahiptir. Literatür taramasına göre, nohutta TALE gen ailesi üzerine herhangi bir araştırma yapılmadığı gözlenmiştir. Bu çalışmada, TALE gen ailesinin 27 üyesi nohutta ilk kez tanınlanmıştır. Biyoinformatik analizlere dayanarak, CaTALE gen ailesi üyeleri BEL1 benzeri (BLH/BELL homeodomain) ve KNOX (KNOTTED benzeri homeodomain) alt ailelerine sınıflandırılmıştır. Ayrıca, tanımlanan CaTALE ailesi üyeleri üzerinde intron-ekzon yapısı tanımlama, korunmuş motif incelemesi, kromozomal dağılım, gen duplikasyonu değerlendirmesi, cis-element incelemesi ve miRNA incelemesi dâhil olmak üzere çeşitli in-silico analizler yapılmıştır. Nohut gelişim çalışmaları, CaTALE genlerinin kuraklık stresi koşulları altında farklı düzenleyici roller oynadığını ortaya koymuştur. Bu genlerin ifade düzeyleri, RNA-seq kuraklık verileri ve PCR incelemesi kullanılarak analiz edilmiştir. Tüm keşifler birlikte değerlendirildiğinde, CaTALE genlerinin çalışması, yapısı, korunmuş bölgeleri, abiyotik stres reaksiyonu ve nohuttaki TALE genlerine ilişkin bilgiler sunmaktadır. Bu çalışmanın sonuçları gelecekteki araştırmacılar için değerli bir kaynak olarak hizmet edebilir.

Özet (Çeviri)

Chickpea is a significant plant due to its economic worth and the nutrients it holds. The TALE transcription factor gene family has a crucial function in plant advancement and development. Based on the literature review, no research has been conducted on the TALE gene family in chickpea. In this study, 27 members of the TALE gene family were recognized in chickpea for the first time. Based on bioinformatic analyses, the CaTALE gene family members were classified into BEL1-like (BLH/BELL homeodomain) and KNOX (KNOTTED-like homeodomain) subfamilies. Additionally, various in-silico analyses were conducted on the identified CaTALE family members, including intron-exon structure identification, conserved motif examination, chromosomal distribution, gene duplication assessment, cis-element examination and miRNA examination. Chickpea development studies revealed that CaTALE genes play distinct regulatory roles under drought stress conditions. The expression levels of these genes were analyze utilizing RNA-seq drought data and qPCR examination. When all discoveries are considered together, the work, structure, preserved districts, abiotic push reaction, and duplication investigation of CaTALE genes have given experiences into the advancement of TALE genes in chickpea. The results of this study could serve as a valuable resource for future researchers.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    109931

    Nohut (cicer arietinum L. ) bitkisinde farklı çeşitler arasındaki genetik polimorfizmin DNA markır teknolojisi ile tanımlanması

    Determining the genetic polymorphism between different chickpea (cicer arietinum L. ) varieties by utilizing DNA marker technique

    YAPRAK AKTEKİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. S. TÜLAY HEKİMBAŞI

  2. Tez No

    546506

    Türkiye'de siyah nohut (Cicer arietinum L.) bitkisinde in vitro rejenerasyon çalışmaları

    In vitro regeneration studies of black chickpea (Cicer arietinum L.) plant of turkey

    ARİFE KİRTİŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUHAMMAD AASIM

  3. Tez No

    997808

    Nohut (cicer arietinum l.) bitkisinde LBD gen ailesi üyelerinin genom düzeyinde tanımlanması ve abiyotik stres cevabı ile olan ilişkilerinin gen ifadesi düzeyinde belirlenmesi

    Identification of LBD gene family members in chickpea (cicer arietinum L.) plant at genome level and determination of their relationship with abiotic stress response at gene expression level

    NESLİHAN ÜNAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİNE SÜMER ARAS

  4. Tez No

    183918

    Bor toksisitesinin nohut (Cicer arietinum L.)bitkisinde bazı fizyolojik ve biyokimyasal özellikler üzerindeki etkileri

    Effects of boron toxicity on some physiological and biochemical characteristics of chickpea (Cicer arietinum L.)

    MURAT ARDIÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    BiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. SÜLEYMAN TOKUR

    PROF.DR. İSMAİL TÜRKAN

  5. Tez No

    418520

    Gümüş nanopartiküllerin nohut (Cicer arietinum L.) bitkisinde bazı fizyolojik ve biyokimyasal özelliklere etkisi

    Some physiological and biochemical properties of silver nanoparticles impact on chickpea (Cicer arietinum L.) plants

    SEFA EKİNCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiAksaray Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FAZİLET ÖZLEM ÇEKİÇ

Geri Dön