Geri Dön

İnvaziv enfeksiyon etkeni olan Pseudomonas aeruginosa izolatlarının antimikrobiyal direnç genlerinin ve epidemiyolojilerinin araştırılması

Investigation of antimicrobial resistance genes and epidemiology of Pseudomonas aeruginosa isolates causing invasive infections

PDF İndir

  1. Tez No: 1007186
  2. Yazar: MELTEM AFACAN CESUR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. EBRU US
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Çalışmamızda Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi İbni Sina Hastanesi Merkez Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gönderilen çeşitli klinik örneklerde üreyen karbapenem grubu antibiyotiklerden en az birine dirençli bulunan Pseudomonas aeruginosa izolatlarının antibiyotik duyarlılığının değerlendirilmesi, taşıdıkları aktarılabilir antimikrobiyal direnç genlerinin taranması ve araştırılması, izolatlar arasındaki epidemiyolojik ilişkinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Bu çalışmada, 30 adet karbapenem grubu antibiyotiklerden en az birine dirençli P. aeruginosa izolatı değerlendirilmiştir. İzolatlar“Matriks assisted lazer desorption ionization time of flight mass spectrometry”ile tanımlanmıştır. İzolatların aminoglikozit, kinolon, karbapenem, sefalosporin ve beta-laktam grubu antibiyotiklere duyarlılıkları Kirby-Bauer disk difüzyon test yöntemi ile belirlenmiştir. Karbapenemler, seftazidim-avibaktam ve kolistin için minimum inhibitör konsantrasyon değerlerinin belirlenmesinde sıvı mikrodilüsyon yöntemi kullanılmıştır. Metallo-beta-laktamaz (MBL) üretimi fenotipik olarak imipenem ve imipenem-EDTA çift disk sinerji testiyle araştırılmıştır. Antimikrobiyal direnç genlerinden genişlemiş spektrumlu beta-laktamaz (GSBL), karbapenemaz genleri ve kolistin direnci için mcr-1 geni varlığı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle araştırılmıştır. İzolatlar arasındaki epidemiyolojik ilişkiler“Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus PCR”(ERIC PCR) ve değişken alanlı jel elektroforezi (PFGE) yöntemleriyle değerlendirilmiştir. Bulgular: İzolatların %46,7'sı servis, %46,7'sı yoğun bakım ve %6,6'sı poliklinik hastalarına ait örneklerinden izole edilmiştir. İzolatlar en sık solunum yolu [%46,7 (endotrakeal aspirat %33,3, bronkoalveolar lavaj %6,7, balgam %6,7)] ve doku örneklerinden (%36,7) elde edilmiştir. Antibiyotik duyarlılık testlerinde izolatların çoğu siprofloksasin (%66,7), levofloksasin (%60), seftazidim (%53,3), sefepim (%60) ve piperasilin-tazobaktama (%60) dirençli bulunmuştur. Meropenem ve imipenem direnci sırasıyla %93,3 ve %86,7 olarak saptanmıştır. Kolistin direnci %30, seftazidim-avibaktam direnci ise %13,3 olarak tespit edilmiştir. Fenotipik yöntemle MBL üretimi iki izolatta (%6,7) pozitif bulunmuştur. Antimikrobiyal direnç genlerinin araştırılması sonucunda, 19 izolatta (%63,3) blaOXA-48-benzeri karbapenemazlar saptanmıştır. Bunların beşinde blaGES, birinde blaPER ve birinde blaCTX-M beta-laktamaz genleri; ikisinde blaVIM, ikisinde ise blaNDM karbapenemaz genleri tespit edilmiştir. Bir izolatta blaOXA-48-benzeri, blaNDM ve blaCTX-M genlerinin beraberliği; bir başka izolatta blaOXA-48-benzeri, blaVIM ve blaGES genlerinin beraberliği saptanmıştır. Plazmidik kolistin direncine neden olan mcr-1 genine rastlanmamıştır. Moleküler epidemiyolojik yöntemlerden ERIC-PCR ile iki izolat aynı, diğer izolatlar farklı olarak değerlendirilmiştir. PFGE ile ise izolatlar arasında klonal ilişki saptanmamıştır. ERIC-PCR ile iki izolat hariç izolatların farklı bant paternine sahip olduğu görülmüştür. PFGE analizinde Gel Compar II programına göre oluşturulan dendrogramda izolatlar arasında %70'den az ilişki olduğu tespit edilmiştir. Sonuç: Bu çalışma karbapenem dirençli P. aeruginosa (KDPA) izolatlarının özelliklerini, antimikrobiyal direnç profillerini ve direnç genlerinin dağılımını detaylı bir şekilde ortaya koymuştur. Direnç genlerinin epidemiyolojisinin anlaşılması için daha çok sayıda izolat içeren daha geniş çaplı çalışmalara ihtiyaç olmakla birlikte, çalışmamız sonucunda elde edilen veriler, KDPA enfeksiyonlarının tedavisinde antibiyotik seçimine ve enfeksiyon kontrol önlemlerine yol gösterici niteliktedir.

Özet (Çeviri)

Aim: Our study aimed to evaluate the antibiotic susceptibility of Pseudomonas aeruginosa isolates resistant to at least one carbapenem group antibiotic, grown in various clinical samples sent to the Central Microbiology Laboratory of İbni Sina Hospital, Ankara University Faculty of Medicine; to screen and investigate the transferable antimicrobial resistance genes they carry; and to determine the epidemiological relationship between the isolates. Materials and Methods: Thirty P. aeruginosa isolates that were resistant to at least one group carbapenem antibiotics were included in this study. The isolates were identified by using the“Matriks assisted lazer desorption ionization time of flight mass spectrometry”. Antibiotic susceptibilities to aminoglycosides, quinolones, carbapenems, cephalosporins, and betalactams were determined by the Kirby-Bauer disk diffusion test method. Minimum inhibitory concentrations for carbapenems, ceftazidime-avibactam, and colistin were determined by using the broth microdilution method. Metallo-beta-lactamase (MBL) production was phenotypically investigated using the imipenem-EDTA double disk synergy test. The presence of antimicrobial resistance genes, including extended spectrum betalactamase (ESBL), carbapenemase genes, and the mcr-1 gene for colistin resistance, was detected by polymerase chain reaction (PCR). Epidemiological relationships between the isolates were established by using the“Enterobacterial repetitive intergenic consensus PCR”(ERIC-PCR) and“Pulsed Field Gel Electrophoresis”(PFGE) methods. Results: 46.7% of the isolates were obtained from ward patients, 46.7% from intensive care unit patients, and 6.6% from outpatient clinic patients. Isolates were most frequently obtained from respiratory tract samples [46.7% (endotracheal aspirate 33.3%, bronchoalveolar lavage 6.7%, sputum 6.7%)] and tissue samples (36.7%). In antibiotic susceptibility testing, most isolates were resistant to ciprofloxacin (66.7%), levofloxacin (60%), ceftazidim (53.3%), cefepim (60%), and piperacillin-tazobactam (60%). Resistance to meropenem and imipenem was found to be 93.3% and 86.7%, respectively. Colistin resistance was detected in 30% of the isolates, while ceftazidime-avibactam resistance was found in 13.3%. Phenotypic analysis of MBL production was positive in two isolates (6.7%). Investigation of antimicrobial resistance genes revealed blaOXA-48-like carbapenemases in 19 isolates (63.3%). Among these, five harbored blaGES, one blaPER, and one blaCTX-M betalactamase genes; two isolates carried blaVIM, and two carried blaNDM carbapenemase genes. One isolate had a combination of blaOXA-48-like, blaNDM, and blaCTX-M genes, while another isolate had blaOXA-48-like, blaVIM, and blaGES genes together. The mcr-1 gene responsible for colistin resistance was not detected. With the molecular epidemiologic methods, two isolates were evaluated as the identical and the other isolates as different by ERIC-PCR. No clonal relationship was detected between the isolates by PFGE. With ERIC-PCR, except for two isolates, the isolates were found to have different band patterns. In PFGE analysis, it was determined that there was less than 70% relationship between the isolates in the dendrogram created according to Gel Compar II program. Conclusions: This study provides detailed insights into the characteristics, antimicrobial resistance profiles and distribution of resistance genes among carbapenem resistant P. aeruginosa (CRPA) isolates. While larger studies with a greater number of isolates are needed to fully understand the epidemiology of resistance genes, the data obtained in our study are indicative of antibiotic selection and infection control measures in the treatment of CRPA infections.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    452900

    Yoğun bakım ünitesinde yatan hastalarda gelişen ventilasyon ilişkili pnömoninin risk faktörlerinin, olası etkenlerinin ve mortalite etkisinin değerlendirilmesi

    Evaluation of risk factors, possible agents and mortality of ventilation associated pneumonia developed in patients who stayed in intensive care unit

    SÜLEYMAN AKSOY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiKocaeli Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MELİHA MERİÇ KOÇ

  2. Tez No

    577464

    Sivas -Cumhuriyet Üniversite hastanesinde nozokomiyal enfeksiyon etkenlerinin dağılımı

    The distribution of nozocomial infection agents in sivas Cumhuriyet University Hospital

    ALİM KEZER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    MikrobiyolojiSivas Cumhuriyet Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ZAHİR BAKICI

  3. Tez No

    424670

    Multipl travmalı hastalarda sağlık hizmeti ilişkili infeksiyonlar; risk faktörleri, mortalite

    Başlık çevirisi yok

    SULTAN AKÇİMEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiAkdeniz Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DİLARA İNAN

  4. Tez No

    710801

    Pseudomonas aeruginosa'ya bağlı nozokomiyal infeksiyonlarda antibiyotik kullanımının ve diğer risk faktörlerinin antibiyotik direnci üzerine etkisi

    Assessment of antibiotic use and other risk factors for pseudomonas aeruginosa resistant nosocomial infections

    MELİHA ÇAĞLA SÖNMEZER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜNAY TUNCER ERTEM

  5. Tez No

    632450

    Atatürk Üniversitesi Tıp Fakültesi Araştırma Hastanesinin yoğun bakım ünitelerinde yatmakta olan hastalarda gelişen hastane enfeksiyonları, etkenleri, antimikrobiyal duyarlılıkları ve mortalite üzerine etkileri

    Hospital-acquired infections, factors, antimicrobial sensitivity and impacts on mortality in patients admitted to intensive care units of Atatürk University, Faculty of Medicine, Research Hospital

    BİLGEN BORULU

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET PARLAK

Geri Dön