Geri Dön

The comparative analysis and characterization of exosomes derived from human placenta organoids and human placenta explant tissue

İnsan plasenta organoidinden elde edilen eksozomların, insan plasenta ekspalnt dokusu eksozomlarıyla karşılaştırmalı incelenmesi ve karakterizasyonu

PDF İndir

  1. Tez No: 1004361
  2. Yazar: KEREM DALĞIÇ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ÇİLER ÇELİK ÖZENCİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Histoloji ve Embriyoloji, Histology and Embryology
  6. Anahtar Kelimeler: İnsan Plasenta Organoidleri, Eksozomlar, Eksplant Kültür, Karakterizasyon, Human Placenta Organoids, Exosomes, Placenta Explant Culture, Characterization
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Koç Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Üroloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Üreme Biyolojisi Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

İnsan plasental organoidleri (HPO'lar), dokuların yapısal mimarisini ve fizyolojik işlevlerini yansıtan önemli in vitro modeler olarak görülmekte olup, ilaç keşfi ve hastalık araştırmaları için dönüştürücü bir platform sunar; ancak anne ile fetüs arasındaki plasental iletişimin kritik aracıları olan eksozomlar henüz tanımlanmamıştır. Bu çalışmanın amacı,insan plasental organoidlerinden türetilen eksozomları karakterize etmek ve bunların fiziksel ve biyokimyasal özelliklerini insan plasental eksplant kültürlerinden (HPEC'ler) türetilen eksozomlara göre değerlendirmektir. Bunun için, birinci trimester plasenta dokularından (6-9 hafta) HPO ve HPEC kültürleri oluşturulmuş ve sonrasında bunlardan salınan eksozomlar diferansiyel ultrasantrifüjleme yoluyla izole edilmiştir. Ekzozom boyutu ve konsantrasyonu nanopartikül takip analizi (NTA) ile, morfolojisi transmisyon elektron mikroskobu (TEM) ile, eksozomal protein belirteçleri Western blot ile, miRNA ekspresyonu (miR-517a-3p ve miR-519d-3p) RT-qPCR ile ve moleküler bileşimi makine öğrenmesi tabanlı analizlerle birleştirilmiş yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi (SERS) ile analiz edilmiştir. Eksozom karakterizasyonu, HPO'lardan türetilen ekzozomların beklenen aralıkta (30-150 nm) karakteristik eksozom morfolojisi ve boyut dağılımları sergilerken, partikül konsantrasyonu HPEC'lerden türetilen eksozomlara göre daha düşük görüldüğünü göstermiştir. Genel ekzozom belirteci olan CD63 her iki eksozom preparatında saptanırken, plasentaya özgü eksozom belirteci PLAP yalnızca term plasenta eksplant örneklerinde gözlenmiştir. Ayrıca HPO'dan türetilen eksozomlarda GAPDH ve β-actin gibi sitosolik proteinlerin bulunmaması, izolasyonlarının yüksek saflıkta olduğunu doğrulamıştır. Plasentaya özgü C19MC miRNA'ların hem HPO'lardan hem HPEC'lerden türetilen miRNA'larda görülmesi, HPO'da önemli plasental parakrin sinyallerin korunduğunu gösterdi. Raman spektroskopisi ve makine öğrenme analizi, HPO ve HPEC'den türetilen eksozomlar arasında korunmuş yapısal imzaları ortaya çıkardı. Yine de, HPO ve HPEC arasında lipitler, nükleik asitler ve proteinlerle ilişkili spectral bölgelerde farklılık olduğu görüldü. Toplamında bu bulgular, HPO'ların plasental eksozomların temel ve yapısal moleküler özelliklerini tekrarladığını ve HPEC'lerden türetilen eksozomlara göre moleküler kargoda kaynağa bağlı farklılıklar sergilediğini göstermektedir. Sonuç olarak, bu bulgular HPO'ları plasental eksozom biyolojisini araştırmak için kontrollü bir in vitro platform olarak desteklerken, aynı zamanda organoid türevli eksozom verilerinin in vivo koşullara yorumlanması sırasında dikkatli olmak gerektiğini vurgulamaktadır. Genel olarak bu çalışma, HPO sistemlerini kullanarak eksozom bazlı tanı, tedavi ve gebelikle ilgili hastalık modellemeye yönelik gelecekteki araştırmalar için temel oluşturmaktadır.

Özet (Çeviri)

Human placental organoids (HPOs) serve as vital in vitro models that mirror the spatial architecture and physiological functions of native tissues, offering a transformative platform for drug discovery and disease research; however, their exosome profiles, critical mediators of placental communication between mother and fetus, remain poorly characterized. The aim of this study is to characterize HPO-derived exosomes and to evaluate their physical and biochemical properties relative to those of exosomes from human placenta explant cultures (HPECs). To address this, HPO and HPEC cultures were established from first-trimester placental tissues, and their secreted exosomes were subsequently isolated via differential ultracentrifugation. Exosome size and concentration were analyzed by nanoparticle tracking analysis (NTA); morphology by transmission electron microscopy (TEM); exosome protein markers by Western blotting; miRNA expression by RT-qPCR; and exosome molecular composition by surface-enhanced Raman spectroscopy (SERS) combined with machine-learning–based analyses. Exosome characterization revealed that HPO-derived exosomes exhibited typical morphology and size distributions within the expected 30-150 nm range, although they showed a lower particle concentration relative to HPEC-derived exosomes. While the general exosome marker CD63 was detected in both preparations, the placenta-specific exosome marker PLAP was observed exclusively in term placental explant cultures. Furthermore, the absence of cytosolic proteins such as GAPDH and β-actin in HPO-derived exosomes confirms the high purity of their isolation. Placenta-specific C19MC miRNAs were detected both in HPO-derived and HPEC-derived exosomes, showing preservation of key placental paracrine signaling features in HPO. Raman spectroscopy and machine-learning analysis revealed conserved structural signatures across HPO- and HPEC-derived exosome groups. Still, they demonstrated differences in spectral regions associated with lipids, nucleic acids, and proteins between HPO and HPEC. Altogether, these findings demonstrate that HPOs recapitulate the fundamental structural and molecular features of placental exosomes and exhibit source-dependent differences in molecular cargo relative to HPEC-derived exosomes. In conclusion, these results support HPOs as a controlled in vitro platform for investigating placental exosome biology while also emphasizing the need for caution when extrapolating organoid-derived exosome data to in vivo conditions. Overall, this study provides a foundation for future research into exosome-based diagnostics, therapeutics, and pregnancy-related disease modeling using HPO systems.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    920065

    Kan plazmasından eksozom izolasyon yöntemlerinin karşılaştırmalı analizi

    A Comparative analysis of exosome isolation methods from blood plasma

    YELİZ ALTINOK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Tıbbi BiyolojiYıldız Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞENAY VURAL KORKUT

    PROF. DR. GÜLŞAH ÇEÇENER

  2. Tez No

    347281

    A comparative narratological analysis of the representation of women in Homer's the Odyssey and Joseph Conrad's Heart of Darkness

    Homeros'un Odysseia ve Joseph Conrad'ın Heart of Darkness adlı eserlerinde kadın temsilinin karşılaştırmalı anlatıbilimsel analizi

    TUĞÇE YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    İngiliz Dili ve EdebiyatıOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    İngiliz Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ELİF ÖZTABAK AVCI

  3. Tez No

    603528

    Comparative analysis of the international regulations and guidelines related to the seismic hazard assessment for nuclear facilities

    Nükleer tesisler için sismik tehlike analizleri ile ilgili uluslararası düzenleme ve kılavuzların karşılaştırmalı analizi

    BARIŞ GÜNER

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Deprem MühendisliğiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Deprem Çalışmaları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP GÜLERCE

    PROF. DR. NURETDİN KAYMAKCI

  4. Tez No

    942857

    The representation of gender roles in remakes: A comparative analysis of Fatma and Unseen

    Yeniden çevrimlerde toplumsal cinsiyet rollerinin temsili: Fatma ve Unseen dizilerinin karşılaştırmalı analizi

    ALİHAN ULU

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2025

    Mütercim-TercümanlıkHacettepe Üniversitesi

    Mütercim Tercümanlık Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SİNEM SANCAKTAROĞLU BOZKURT

  5. Tez No

    1001907

    Polimer ve nanokompozit malzemelerle üretilen silah şarjörlerinin termal, dinamik ve statik performansının karşılaştırmalı analizi

    Comparative analysis of the thermal, dynamic, and static performance of firearm magazines produced with polymer and nanocomposite materials

    HÜSEYİN OTHAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    Mekatronik MühendisliğiMarmara Üniversitesi

    Mekatronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ERSİN TOPTAŞ

    DOÇ. DR. ŞENOL ŞİRİN

Geri Dön