Faruk suyu (Van-Köşebaşı köyü)'dan izole edilen bacillus cinsi bakterilerin ektraselüler hidrolitik enzim üretme kabiliyetlerinin belirlenmesi ve 16s rDNA analizi
Determination of the extracellular hydrolytic enzyme production potential and 16s rDNA analysis of bacillus species isolated from Faruk stream (Van–Köşebaşi village)
- Tez No: 1002138
- Danışmanlar: DOÇ. DR. HAMDULLAH SEÇKİN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, Van ilinde yer alan Faruk Suyu ve çevresindeki su ve toprak örneklerinden izole edilen bakteriler değerlendirilmiş olup özellikle Bacillus cinsi mikroorganizmaların fenotipik, biyokimyasal ve moleküler özellikleri ayrıntılı olarak incelenmiştir. İzolasyon sonucunda toplam 21 bakteri suşu elde edilmiş ve bu suşların çeşitli enzim aktiviteleri belirlenmiştir. Enzim analizleri kapsamında izolatların %47.6'sının amilaz, %42.8'inin proteaz, %9.5'inin üreaz, %4.7'sinin ksilanaz aktivitesi pozitif bulunmuştur. Lipaz (T80) aktivitesi tüm izolatlarda negatif iken, katalaz aktivitesi %95.2 oranında pozitif saptanmıştır. Bu bulgular, Faruk Suyu ve çevresinin hidrolitik enzim üreten Bacillus türleri açısından zengin bir mikrobiyal çeşitliliğe sahip olduğunu göstermektedir. Moleküler teşhis kapsamında 16S rRNA gen bölgesi dizilenmiş ve analiz sonucunda izolatların büyük çoğunluğunun Bacillus subtilis, B. pumilus, B. licheniformis ve B. thuringiensis türleriyle %98–100 benzerlik gösterdiği belirlenmiştir. Moleküler veriler kullanılarak oluşturulan filogenetik dendrogram, suşların referans türlerle olan ilişkilerini açık bir şekilde ortaya koymuştur. Ayrıca tek bir izolatta Arthrobacter scleromae türü ile yakınlık saptanmış, bu da çalışma alanının Bacillus dışındaki türleri de barındırdığını göstermiştir. Çalışmadan elde edilen bulgular, Faruk Suyu ve çevresinin biyoteknolojik açıdan değerli enzimler üretebilen Bacillus suşları için önemli bir doğal kaynak olduğunu ortaya koymaktadır. Özellikle amilaz ve proteaz pozitif izolatların yüksek oranı, bu suşların gıda endüstrisi, biyodönüşüm, tekstil ve diğer endüstriyel süreçlerde kullanılma potansiyelini artırmaktadır. Ayrıca katalaz aktivitesinin yaygınlığı, bölgedeki bakterilerin oksidatif stres koşullarına yüksek adaptasyon kabiliyeti geliştirdiğini göstermektedir. Bu çalışma, gelecekte yapılacak enzim saflaştırma, fermantasyon optimizasyonu ve genetik karakterizasyon araştırmaları için kapsamlı bir temel oluşturmaktadır.
Özet (Çeviri)
In this study, bacteria isolated from water and soil samples collected from Faruk Stream and its surrounding area in Van Province were evaluated, with particular emphasis on the detailed investigation of the phenotypic, biochemical, and molecular characteristics of Bacillus species. As a result of the isolation process, a total of 21 bacterial strains were obtained, and various enzyme activities of these strains were determined. Enzyme analyses revealed that 47.6% of the isolates were positive for amylase activity, 42.8% for protease activity, 9.5% for urease activity, and 4.7% for xylanase activity. Lipase (T80) activity was negative in all isolates, whereas catalase activity was detected in 95.2% of the strains. These findings indicate that Faruk Stream and its surrounding environment harbor a rich microbial diversity, particularly in terms of Bacillus species capable of producing hydrolytic enzymes. Within the scope of molecular identification, the 16S rDNA gene region was sequenced, and the analysis demonstrated that the majority of the isolates showed 98–100% sequence similarity with Bacillus subtilis, B. pumilus, B. licheniformis, and B. thuringiensis. The phylogenetic dendrogram constructed based on molecular data clearly illustrated the relationships between the isolates and reference strains. In addition, one isolate exhibited close similarity to Arthrobacter scleromae, indicating that the study area also hosts bacterial species other than Bacillus. The results obtained from this study demonstrate that Faruk Stream and its surrounding area represent an important natural source of Bacillus strains capable of producing biotechnologically valuable enzymes. In particular, the high proportion of amylase- and protease-positive isolates enhances the potential applicability of these strains in the food industry, bioconversion processes, textile manufacturing, and other industrial applications. Furthermore, the widespread presence of catalase activity suggests that the bacteria in this region have developed a high capacity for adaptation to oxidative stress conditions. Overall, this study provides a comprehensive foundation for future research focusing on enzyme purification, fermentation optimization, and genetic characterization.
Benzer Tezler
- Van ve Mardin illerine bağlı bazı köylerde içme sularının fiziksel özellikleri ve mineral içeriklerinin incelenmesi
Examination of physicalpropertiesand mineral contents of drinking water in some villages in van and Mardin provinces
MERVE GİZEM BARAJ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Veteriner HekimliğiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiVeterinerlik Biyokimyası Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİHAT MERT
- Erciş-Çaldıran-Muradiye (Van) bölgesinin hidrojeolojik ve jeotermal incelenmesi
Hydrogeological and geothermal studies of the Ercis-Caldiran-Muradiye (Van) region
HACER DÜZEN
Doktora
Türkçe
2017
Jeoloji Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAYRETTİN KORAL
YRD. DOÇ. DR. RÜSTEM PEHLİVAN
- XRF ve ICP-OES teknikleri ile van gölü'nün su ve sedimentinin eser element analizi
Trace element analysis of van lake's water and sediment using XRF and ICF - OES technique
FATMA AKDEMİR
Doktora
Türkçe
2014
Fizik ve Fizik MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RIDVAN DURAK
- Van ili ve çevresinde riskli insan ve hayvan gruplarında tularemi seroprevalansı
The seroprevalence of tularemia in the risk groups of human and animal in Van around
AYŞE ÖZKAÇMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2014
MikrobiyolojiYüzüncü Yıl ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN BAYRAM