Sepsisli hastalarda kan ve bağırsak mikrobiyom analizlerli ile tanısal biyobelirleyicilerin ve inflamazom yanıtının araştırılması
Investigation of diagnostic biomarkers and inflammasome response through blood and gut microbiome analyses in patients with sepsis
- Tez No: 1000630
- Danışmanlar: PROF. DR. AYŞE MELTEM YALINAY
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gazi Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Sepsis, enfeksiyona karşı gelişen düzensiz konak yanıtı sonucu ortaya çıkan, yaşamı tehdit eden bir hastalıktır. Kan, sepsis gibi hastalıklar dışında steril olarak kabul edilmektedir. Kan kor mikrobiyomu üzerinde çok durulan, ortaya konması zor olan ve kanıt gereksinimi duyulan önemli bir konudur. Bu çalışmada, sepsis hastaları ve sağlıklı kontrol grubunun bağırsak ve kan mikrobiyomlarının metagenom analizleriyle, kan kor mikrobiyomunun varlığının gösterilmesi, kan ve bağırsak mikrobiyomları ile inflamazom ve enfeksiyona ilişkin parametrelerin karşılaştırılması ve sepsis tanısında kullanılabilecek potansiyel mikrobiyal biyobelirleyicilerin ortaya konması amaçlanmıştır. Sepsis tanısı almış 20 yetişkin hasta ile 20 sağlıklı gönüllüden alınan kan ve gaita örneklerinde metagenom analizi ile ortaya konan mikrobiyom profili ile inflamazom ve enfeksiyona ilişkin en sık kullanılan parametreler arasındaki ilişki değerlendirilmiştir. Kontrol ve hasta kan örneklerinde mikrobiyom profilleri saptanmıştır. Kontrol ve hastaların kan ve bağırsak mikrobiyomları karşılaştırılmış, alfa ve beta çeşitlilik analizlerinde istatistiki olarak anlamlı farklılıklar (p<0,05) saptanmıştır. Hasta ve kontrol grubu kan mikrobiyomları arasında DESeq2 analizi ile Selenomonas ve Massilia (p<0,05) cinsleri sepsis tanısında potansiyel biyobelirleyiciler olarak öne çıkmıştır. Hasta ve kontrol grubunda inflamazom paternine yönelik NLRP-3, IL-1β ve IL-18 düzeylerine bakılmıştır. Sepsisli hasta ve kontrol grupları arasında istatistiki olarak anlamlı farklılıklar (p<0,05) saptanmıştır. İnflamazom düzeyleri ile mikrobiyom analiz sonuçlarının korelasyon analizi yapılmış ve sepsisli hastalardaki inflamazom yanıtını ile istatistiki olarak pozitif ilişkili (p<0,05) Enterococcus casseliflavus Bulleidia moerei ve Porphyromonas endodontalis türleri ortaya konmuştur. Sepsis tanısında kullanılan CRP, laktat ve PCT gibi biyobelirleyiciler ile kan ve bağırsak mikrobiyomu korelasyon analizi yapılmış ve sepsis hastalarında istatistiki olarak pozitif ilişkili (p<0,05) Streptococcus anginosus, Haemophilus parainfluenza ve Lactobacillus reuteri türleri ortaya konmuştur. Sonuç olarak bu çalışmada sepsisli hastaların ve sağlıklı bireylerin kanlarındaki mikrobiyom profili ortaya konmuştur. Bildiğimiz kadarıyla bu çalışma sepsisli hastalar ve sağlıklı bireylerde bağırsak ve kan mikrobiyom profillerinin metagenomik olarak birlikte ortaya koyan dünyadaki ilk çalışmadır. Sepsisli hastalar ve sağlıklı bireylerde metagenomik olarak ortaya konan bağırsak ve kan mikrobiyom profillerinin her ikiside sepsis tanı tedavi ve takibinde kullanılabilecek potansiyel biyobelirleyiciler olabileceğini ortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
Sepsis is a life-threatening organ dysfunction caused by a dysregulated host response to infection. Blood is considered sterile except in diseases such as sepsis. The blood core microbiome is an important topic that has received considerable attention, is difficult to demonstrate, and requires evidence. This study aimed to demonstrate the existence of the blood core microbiome through metagenomic analysis of the gut and blood microbiomes of sepsis patients and a healthy control group, to compare blood and gut microbiomes with inflammasomme and infection-related parameters, and to identify potential microbial biomarkers that can be used in the diagnosis of sepsis. The relationship between microbiome profiles, as revealed by metagenome analysis in blood and stool samples from 20 adult patients diagnosed with sepsis and 20 healthy volunteers, and the most commonly used parameters related to infection and inflammasomes was evaluated. The blood and gut microbiomes of controls and patients were compared, and statistically significant differences (p<0.05) were detected in alpha and beta diversity analyses. Selenomonas and Massilia (p<0.05) emerged as potential biomarkers for sepsis diagnosis in the DESeq2 analysis of patient and control group blood microbiomes. NLRP-3, IL-1β, and IL-18 levels related to the inflammasome pattern were examined in the patient and control groups. Statistically significant differences (p<0.05) were detected between the sepsis patient and control groups. A correlation analysis was performed between inflammasome levels and microbiome analysis results, revealing that the inflammasome response in patients with sepsis was statistically positively associated (p<0.05) with the species Enterococcus casseliflavus, Bulleidia moerei, and Porphyromonas endodontalis. Correlation analysis was performed between biomarkers used in sepsis diagnosis, such as CRP, lactate, and PCT, and blood and gut microbiome. Streptococcus anginosus, Haemophilus parainfluenza, and Lactobacillus reuteri species were found to be statistically positively correlated (p<0.05) in sepsis patients. As a result, this study revealed the microbiome profile in the blood of patients with sepsis and healthy individuals. To our knowledge, this is the first study in the world to metagenomically reveal gut and blood microbiome profiles in both septic patients and healthy individuals. It has demonstrated that both the gut and blood microbiome profiles identified metagenomically in septic patients and healthy individuals could be potential biomarkers for use in the diagnosis, treatment, and follow-up of sepsis.
Benzer Tezler
- Development of mirna biomarkers for the differentiation between gingivitis and periodontitis: A pilot study
Gingivitis ve periodontitis ayrımı için mirna biyobelirteçlerinin geliştirilmesi: Pilot çalışma
DHAFIR LATIEF FAYADH FAYADH
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaSüleyman Demirel ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA CALAPOĞLU
- Tromboelastografi, sepsisli hastalarda gelişen koagülasyon bozukluklarının değerlendirilmesinde yardımcı olabilir mi?
May Tromboelastography be helpful for the evolution of coagulation disorders in patients with sepsis?
YELİZ KILIÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Anestezi ve ReanimasyonCelal Bayar ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İSMET TOPÇU
- Yoğun bakımda yatan ağır sepsisli hastalarda düşük-orta doz vazokonstriktör ve vazodilatatör ajanların doku mikrosirkülasyonuna etkilerinin doku oksimetri yöntemi ile değerlendirilmesi
The microcirculatory effects of low to medium dose vasoconstrictor and vasodilatator agents detected by tissue oxygenation in severely septic patients
ALTAY İSKENDER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Anestezi ve ReanimasyonSağlık BakanlığıAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
UZMAN ASU ÖZGÜLTEKİN
- Sepsisli hastalarda omega-3 yağ asidi ile desteklenmiş total parenteral beslenmenin biyokimyasal ve inflamatuar parametrelere etkisi
Effect of omega-3 fatty acids enriched total parenteral nutrition on biochemical and inflammatory parameters of patients with sepsis
SAADET GAMZE AKÇA
Yüksek Lisans
Türkçe
2008
Beslenme ve DiyetetikErciyes ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HABİBE ŞAHİN
- Sepsisli hastalarda nöron spesifik enolaz (NSE) ve S-100 β belirteçlerinin araştırılması
Research of neuron specific enolase (NSE) and S-100 β markers in patients with sepsis
BEHİÇ VOLKAN BOZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
İlk ve Acil YardımDüzce ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYHAN SARITAŞ